100部队与731部队是孪生的一对恶魔。它们名义上都隶属于关东军司令部，实际上直接由日本大本营日军参谋本部指挥。100部队由关东军司令部的兽医部指导，负责人是中将兽医部长高桥隆笃。伪满大陆科学院的兽医处（对外称马疫研究所）处长安达诚太郎、中将北野政次对其也负有指导责任。其前身是驻屯在长春宽城子的号称高桥部队的“关东军马匹防疫场”。1938年迁至长春以南10公里的孟家屯。经过扩建后，改用了“满洲第100部队”的秘密番号。

100部队位于日军营群中央的一块截然孤立的地方，营区面积东西宽1华里，南北长2华里。它的规模小于731部队，拥有日籍研究和工作人员800人，中国劳工大约300人。本部下设总务部和4个细菌生产研究部门，1940年以后，在大连、海拉尔（后迁至克山）、佳木斯、拉古（位于牡丹江市附近）等地建立了所属的支队。苏德战争爆发后不久，它除在四平设立支队外，在关东军所属的部队里，都奉令设立了军团兽医部队，分驻克山、东安、鸡宁、四平等地区，配合100部队的细菌战活动。

它是以家畜和植物为主要研究对象的细菌部队，同时还研究畜类病菌对活人的杀伤力。以此为目的，他们配备了足够数量的细菌学、化学、生物学、和兽医专家学者，进行烈性病菌和毒药的研究和制造，并把牲畜、植物和活人当做“实验品”：进行病毒菌的传染实验，以寻求用菌毒来大批杀害人命和牲畜的方法。

100部队由本部、分厂和军团兽医部队三部分构成，其中本部是由总务部、教育部和业务第一、第二、第三、第四部构成，分支机构主要在大连、牡丹江等地。所谓的“军团兽医部队”则是第100部队与一线部队结合所设立的特殊的细菌部队，比如日军第20军的2631部队、第11军的2630部队。至1945年，100部队约有940人。

在第100部队服役过的上士试验员三友一男二战后在苏联伯力接受审问时供认，在他的操作下，每年可生产一千公斤炭疽菌，或生产鼻疽菌五百公斤。材料披露，第100部队用牲畜做实验时，常有意给牲畜传染上病菌，再赶到附近的村庄和牧场，实验病菌的效能。附近老百姓家里的牲畜常常会得上传染病死去。第100部队还多次深入前沿阵地，进行细菌攻击武器实验。

一个叫庄歧的农民曾在地下室里看见过三个“炼人”用的火化炉，上面有厚厚的骨灰。1949年春天，附近农民到“牲畜掩埋厂”挖马骨头卖钱，结果挖出大量人的骨头。三友一男也供述说，1943年，他曾在七名“实验材料”上做毒物实验，其中一人喝下含有一分克海洛因的稀粥后十五分钟死亡。大量事实证明，第100部队用活人做过细菌实验。然而，究竟有多少无辜的中国人被残暴杀害，至今未可知。学者说，焚尸炉里的骨灰和地里挖出的人骨头表明，被残害的中国人是大量的。

第100部队成员、陆军兽医少尉安藤敬太郎证实，曾亲眼看见把活人当作豚鼠做实验。战后,第100部队的陆军兽医大内保、西村武志等人向驻日盟军司令部揭发第100部队长官若松有次郎进行人体活体实验。现存美国的“A报告”和“G报告”，更是以生动的图文记录形式，直接指出第100部队曾用人体活体进行炭疽菌和鼻疽菌效能实验并进行了残忍的活体解剖。

第100部队曾在海拉尔等地进行过野外细菌试验，还曾参与过在诺门坎战役中向苏军投送包含鼠疫、霍乱等烈性传染病菌等溶液和细菌弹。当时东北一些地方发生的鼠疫，也被证明与第100部队有关系。

1946年8月中旬，100部队播下的霍乱才逐渐平息。

2018年5月7日，来自俄罗斯国立录音档案馆的伯力审判录音档案正式被长春伪满皇宫博物院收藏。这份录音档案长达22个小时多，通过战犯的供述揭露了侵华日军第731部队、第100部队的细菌战罪行。

2022年9月，作为国家社科课题，伪满皇宫博物院课题组经过四年研究整理，公布了阶段性最新研究成果，侵华日军100细菌部队的罪行也随之公诸于世。侵华日军731部队的罪行众所皆知，但很多人不知道的是，当年的东北还有另一支神秘的部队，那就是侵华日军100细菌部队。这支部队被称作隐藏在731部队身后的“恶魔兄弟”。日军投降前，该部队销毁了大部分资料，其罪行至今鲜为人知。

100部队与臭名昭著的731部队均为日本关东军司令部直属的秘密部队，相关活动信息均为当年的机密，人们对它的认知很少。日本战败前夕，100部队根据日本陆军省的命令，提前撤退人员，并销毁了相应的实验设施、记录资料，妄图擦去历史血痕。该部队的罪恶隐藏几十年后，长春伪满皇宫博物院课题组于2018年开始搜集100细菌部队的相关罪证。

经过四年多努力，我们从中、日、美、俄四国搜集到了关于这支部队的组织、人员、机构以及细菌战步骤的相关的档案、历史见证人的口述、文物文献等资料，同时我们在丰富资料的基础上也出了相应学术成果。

通过对多国留存相关资料的相互比对、互证研究，侵华日军100细菌部队隐藏的罪恶由模糊到清晰，最终大白于天下。最新披露的成果主要有：100部队是遵照日本陆军省和参谋本部的命令，自上而下改编而成的细菌部队，该部队曾进行过人体活体实验、野外毒性试验和野外演习，进攻对象为整个生态系统。

2024年9月18日，在“九一八”事变93周年纪念日来临之际，侵华日军第七三一部队罪证陈列馆与日本学者松野诚也联合发布了一份最新发现的史料文献《陆军高等文官名簿 陆军书记官 陆军技师》。《陆军高等文官名簿 陆军书记官 陆军技师》发现于日本国立公文书馆，由日本陆军复员课在1945年编制完成，共267页，详细记载了从1944年2月至1945年8月日本细菌战部队的“技师”基本资料，总计100人。其中，包括100部队16人，对其上任时间、晋升履历、出身大学、取得成绩等有明确记载。

2022年8月，日本横滨神奈川县民中心举办了一场揭露侵华日军细菌战罪行的活动。主讲人小河孝教授向到场的500多名日本民众介绍了臭名昭著的“731部队”的“恶魔兄弟”——原侵华日军第100部队在华研究实施细菌战的情况，重申侵华日军的罪行铁证如山，历史不容歪曲。