凡在2016年5月20日前，向中国足协备案本地业余足球比赛的会员协会，有资格申报一支队伍报名参加2017年中国足协杯资格赛预赛阶段的比赛（以上直接晋级资格赛决赛的球队可不占此名额），申报球队的优先选择及递补顺序如下：1、会员协会组织的杯赛冠军队；2、会员协会组织的联赛冠军队；3、会员协会组织的杯赛亚军队；4、会员协会组织的联赛亚军队。其他成绩的球队无资格申报。

2016年中国足协杯正赛进入第三轮的3支业余球队和获得2016年“我爱足球”中国足球民间争霸赛11人制组前4名的队伍共七支球队直接晋级中国足协杯资格赛决赛阶段。其余九支球队由预赛阶段产生。

预赛阶段将报名球队按所属会员协会排名顺序进行排名，并按照蛇形排列对阵进行一至三轮的单场淘汰赛，最终胜出9支球队晋级资格赛决赛阶段。球队所属协会按如下顺序进行排名：（1）所属会员协会业余足球俱乐部最近4年（2013年-2016年）参加中国足协杯赛正赛总场次，场次多的列前。（2）最近年度参加中国足协杯赛正赛场次（先比较2016年，如相等再比较2015年，……以此类推到2012年）。（3）最终有效报名表提交的先后顺序（以发到指定传真机的时间为准）。