地震地表最大加速度（Gal）前10位观测点见下表（日本防灾科学技术研究所观测）：

自2018年9月6日3时7分起，截至2018年9月6日16时（JST），日本气象厅观测到烈度1以上余震68次（烈度4：2次、烈度3：9次、烈度2：22次、烈度1：35次）。

自地震后发生的最大烈度4以上（日本气象厅测定，截至2018年9月6日16时，JST）余震参见下表：

截至2018年9月6日16时（JST），本次地震已累计造成4人死亡，约300人受伤，另有33人下落不明。

截至2018年9月7日9时，地震已造成16人死亡，26人失踪。

截至2018年9月7日晚上10点，地震已造成18人死亡、2人处于心肺功能停止状态，仍有19人失联。

截至2018年9月8日早上，日本官房长官菅义伟在记者会上表示，北海道地震已经导致21人死亡，6人心肺功能停止，另有13人失联。

截至2018年9月8日晚上，北海道地震已经导致死亡人数上升至35人，约有640人受伤、3人失踪。

截至2018年9月8日，仍有5人未找到，警察和消防人员一致认为，该5人可能是被压在倒塌的住宅和沙土下面，仍在进行紧张的搜索、搜救。

截至当地时间2018年9月9日11点，北海道地震已经导致37人死亡，1人心肺功能停止，另有2人下落不明。此外，北海道仍有5800人在避难所避难。

北海道地震已造成39人死亡，仍有1人失联。

截至当地时间2018年9月9日晚，北海道地震已造成42人死亡，仍有1人失踪。由警察、消防员及日本自卫队组成的救援队正在坚持搜救失踪者。北海道地区仍有2600人在避难所生活，8000户居民断水。北海道地区电力供应基本恢复，但达不到震前用电高峰时的需求水平。

截至当地时间2018年9月10日上午，日本北海道地震已经导致44人死亡，已无失联人员。

2018年9月6日，日本将地震强度定为6强。据日本气象厅的震度等级区分，6强表示大部分不稳固的重家具移动和倒下，大部分房屋的墙砖和玻璃窗受损下堕，大部分非钢筋混凝土的砖墙倒塌，耐震能力较差的房屋倒塌，耐震能力较强的房屋亦有可能严重受损。

受地震影响，札幌市新千岁机场因停电及漏水等原因一度关闭。机场于7日中午重新开放，有大批旅客涌入。航空公司方面表示，当日于新千岁机场起降的航班中，共有逾100架航班取消，超过1.7万人受到影响。

此外，地震也造成北海道诸多地区停电，约295万户受影响。虽然部分地区已陆续恢复供电，但居民生活仍大受影响。

9日—10日期间将出现降雨天气。在地震晃动严重的地区，由于地基松动，今后的雨水有可能加剧地质灾害的危险，因此呼吁人们严加防范。

受地震引发的长时间停电影响，北海道奶农的一些挤奶、冷藏等设备一度无法使用，导致相关产品产量降低。此外，北海道向其他地区的蔬菜运输中有约4成依靠日本货物铁道公司货运线路，但该公司的货运线路受地震影响出现延误或停运，导致其他地区超市内北海道产蔬菜货量骤减，部分菜品已开始涨价。

该地震引发了北海道几乎全境停电，持续不断的余震也给主要产业之一的旅游业带来沉重打击。据北海道政府介绍，截至2018年9月30日，共有114.9万人次取消酒店住宿，如果加上交通费及餐饮、购买礼品的费用，受影响总额达356亿日元（约合人民币21.5亿元）。

2018年9月6日，日本官房长官菅义伟称安倍首相已经发出指示，要求与地方政府联合全力救灾。

2018年9月6日早上，安倍在首相官邸回应此次地震时说，“人命第一，政府要团结一致共同应对紧急灾害”。安倍表示，他已经收到关于地震造成的影响报告，他强调要坚定不移地进行危机管理。

2018年9月9日，日本首相安倍晋三赴北海道，他在造成多人遇难的厚真町山体滑坡现场默哀。安倍还前往有大约150人避难的厚真中央小学等处，慰问和激励了受灾民众。之后，安倍回到首相官邸召开相关阁僚会议，表示将从国家预备金中拨款5.4亿日元（约合人民币3327万元）支援受灾地区。

2018年9月10日，日本官房长管菅义伟召开的记者会上公布消息称，此次地震已经导致44人死亡，没有其他心脏停跳及失踪人员。

2018年9月8日，位于北海道的新千岁机场已恢复了国际航线的运行，由此国内航线和国际航线已全面恢复运行。有的航空公司还决定派出临时航班，因此各航空公司提醒乘客通过网站等渠道确认最新的航班运行情况。

关于此前全面停运的特急列车，北海道铁路公司(JR北海道)9日恢复了连接札幌、旭川、网走等区段的列车。札幌市一部分持续停水的地区已基本恢复供水。

截至2018年9月9日，北海道铁路和航空运输情况进一步好转。北海道通往本州地区的货运列车恢复运行，当地铁路运营商开通了连接札幌和岛内其他城市的特快列车，距震中不远的新千岁机场国内航线恢复到震前90%水平，国际航线则完全恢复。

日本东京大学地震研究所的教授对这次地震分析指出，地震发生的周边为地震活跃带，震感强烈的地区，建筑物可能损坏，地盘容易松动。今后可能发生强烈余震，建议如果感到建筑物受损，首先要考虑转移到安全的场所避难。专家指出，今后一周之内必须警惕强烈的余震，气象厅会召开记者会，也将呼吁民众今后一周之内注意余震。