更新时间：2024-06-25 18:10
横滨足球俱乐部成立于1999年，当时横滨市两大球队：横滨飞翼和横滨水手合并后的第二年，一些横滨飞翼的球迷不认为自己应该支持合并后的横滨水手，因为实际上飞翼已经解散，和横滨水手是横滨飞翼的同市死敌。所以，他们向公众募捐，与国际管理集团结盟，和集合横滨飞翼的球迷，成立了横滨Fulie体育俱乐部（Yokohama Fulie Sports Club）。然后他们仿效巴塞罗那采用的社会学模式，在Fulie体育俱乐部下成立了横滨足球俱乐部，这是日本首家由球迷拥有和经营的球队。
成立后的首季（即1999年），横滨足球俱乐部聘请了前联邦德国国家足球队球星皮埃尔·利特巴尔斯基为经理，首位在欧洲职业联赛效力的日本球员奥寺康彦担任主席。他们首季只能获准于日本足球联赛（JFL联赛），未能直接于顶级联赛角逐。球队在日本足球联赛连续夺得两个赛季冠军后升级至日本职业足球乙级联赛（J2联赛）。
球队在J2联赛角逐了6个赛季，在2001年至2005年位列中游。不过，他们于2006年赢得J2联赛冠军，获得直接升级至日本职业足球联赛（J1联赛）的资格。在2007年，即俱乐部成立的九年后，他们首次于日本联业足球顶级联赛亮相。
2022年1月，三浦知良租借加盟铃鹿FC。
2024年6月，三浦知良从横滨FC租借加盟铃鹿FC。
2023赛季一线队名单，更新于2023年4月15日。
横滨足球俱乐部虽然在2005年只能在12支参加J2联赛球队中排第11，但俱乐部在2006赛季表现出色获得联赛第一升入J1联赛。他们有如戏剧般成功的故事在日本带来很大的震撼，因为横滨足球俱乐部的财政不太健康，连自己的主场馆和会址也没有。每位球员要做他们自己的事，包括清洗球衣和搬龙门架；阵中一些球员曾是日本国家足球队国脚，如39岁的三浦知良、37岁的山口素弘和同样已37岁的小村德男。球队在赛前热身赛全部落败，即使对手只是大学生。球队在首场联赛落败后选择更换主教练为38岁的高木琢也，他是一个缺乏经验的新人，并且很多人都不相信他可以带领球队在本赛季取得好的表现。高木琢也着重防守和简单战术，执教的前15场比赛没有失球，最终赢得联赛冠军。
2007赛季，横滨足球俱乐部打破J1联赛多项纪录，包括最快降级、最少入球、最多失球、最少积分等。（这一记录被2014赛季的德岛漩涡打破）
2024年3月，横滨FC官方宣布，球队租借高桥利树。
日本职业足球乙级联赛冠军（1）：2006年
名字 国籍 任期
皮埃尔·利特巴尔斯基 德国 1999年-2000年
永井良和 日本 2001年
阪仓裕二 日本 2001年
信藤健仁 日本 2001年-2002年
皮埃尔·利特巴尔斯基 德国 2003年-2004年
足达勇辅 日本 2005年-2006年
高木琢也 日本 2006年
参考资料：