蛋白质是所有生命功能的基本组成部分。蛋白质是由称为氨基酸的小分子组成的长链。酶是可以加速生物化学反应的特殊蛋白质。蛋白酶是可以在氨基酸链的某个点将蛋白质切断的酶。例如，当您食用包含蛋白质的食物时，胃中的蛋白酶就会将蛋白质分子“切割”成较小的氨基酸分子。然后，您的身体可以利用这些氨基酸构建自身所需的蛋白质。生物体内的蛋白质中只有很小一部分是蛋白酶，但它们对于维护正常的生命过程起着非常重要的作用。但并不是所有的蛋白酶都是有益的。HIV 会产生并使用一种特殊的蛋白酶，叫做“HIV-1 蛋白酶”，来制造该病毒的各种蛋白质。

这就是配合体(ligand) 的用武之地。配合体是来自细胞外部的小分子，可以附着或“粘连”在蛋白质的凹槽中。这些凹槽有时称为“受体”。您可以将配合体附着在受体上想象成钥匙插入锁中。FightAIDS@Home 项目用于搜索配合体（药物），这些配合体将附着在 HIV-1 蛋白酶的受体上，从而抑制其发挥酶的功能。这样就可以防止病毒在体内进一步扩散而发展成为爱滋病。抑制 HIV 蛋白酶的分子叫做“蛋白酶抑制剂”。

您的计算机使用称为 AutoDock 的计算机程序，通过模拟许多配合体与 HIV-1 蛋白酶的粘连过程，为该项目提供帮助。科学家们会更为详细地研究最有希望的配合体，以研制出更好的蛋白酶抑制剂药物来控制 HIV 并最终攻克爱滋病。

FightAIDS@Home 已由Olson实验室独立运作了两年半，现在加入World Community Grid计算平台，一个以运作人类公益的项目作为使命的公共计算网格。当前 FightAIDS@Home客户端是从Entropia继承的，但未能同时兼顾到 FightAIDS@Home成员和Olson实验室。有几个特性未能从 Entropia 环境带到这个项目，而且新版本的AutoDock代码不能在这系统上执行。

World Community Grid 只为公共和非盈利性机构在人类所面临的最棘手的研究问题上提供技术支持，该技术使得那些曾经需要利用高昂的计算成本的科研项目可以借助网格计算的巨大力量而尽快解决。改善人类的生存环境是我们的神圣义务，我们所得到的所有计算结果都将用于全人类的公共事业中。IBM 公司已经捐献了硬件、软件、技术服务和专家意见建造了 World Community Grid 的基础设施，并提供免费主机托管、维护和支持。