更新时间：2024-10-04 20:28
在很久以前，有一名训练家在与路卡利欧结伴来到了卡洛斯地区时，找到了两块不可思议的石头，出现了最初的超级进化。
超级进化的关键，在于玩家身上的钥石与宝可梦携带的超级石所产生的共鸣，据说只有训练家与宝可梦之间拥有足够深的羁绊，才能引发两块石头隐藏的力量。
当玩家与宝可梦的心意相通，两块石头共鸣之时，宝可梦将会发生超级进化。
在满足所有超级进化的条件之后，下屏底部会出现超级进化的图标且闪光，选择超级进化后，再选择上方的招式，便可超级进化和攻击。超级进化不占用回合数，如果选择超级进化的图标后而不选择招式，返回菜单，那么超级进化的选项将会自动取消，需要再次点击。
要进行超级进化，必须在对战之前，由该宝可梦携带相对应的超级石，也要有一定的亲密度。战斗时，主角以食指和中指触碰另一手手腕上超进化环中的钥石，和宝可梦身上所携带的超级石产生共鸣，使宝可梦在该回合对战双方使用绝招之前发生超级进化。但并非所有人的钥石都放置于超进化环上，例如道馆训练家可尔妮的钥石位于手套上、闪焰队首领弗拉达利的钥石位于戒指上、冠军卡露乃则放置于项链上。
条件方面，在每场对战中，主角的队伍只能有一只宝可梦发生超级进化，但队伍里可以存在多只携带超级石的宝可梦，在对战未结束之前，已进行超级进化的宝可梦无法变回原来的样子，就算交换也一样，且即使该宝可梦濒死，其他宝可梦也无法进行超级进化，复活后也只能恢复一般状态，无法再次进行超级进化。对战结束后，已进行超级进化的宝可梦将会恢复原样。
宝可梦的攻击顺序是根据超级进化时所使出的招式的速度来判定的，和超级进化后的速度并无关联。超级进化后，拥有超级进化特性的宝可梦会自动转换特性。
超级进化不受宝可梦的睡眠、冰冻状态等无法行动限制，无视扣押状态。但对于正在使用多回合攻击技、蓄力技、硬直技等完全跳过命令阶段的场合，自然无法进行超级进化。
在战斗中，如果一只宝可梦携带对应的超级石，则宝可梦与道具自动绑定，无论是否进行超级进化。打落、戏法等招式对绑定的超级石无效，并且不能将一个超级石交换给其对应的宝可梦。但如果携带的超级石并不与宝可梦对应，则和其它道具相同。当宝可梦变身为其它宝可梦时，也无法触发超级进化。超级进化命令不受特性影响。
主词条：原始回归
原始固拉多是地面和火属性宝可梦，特性为终结之地（おわりのだいち，Desolate Land），可以制造阳光强烈的天气，直到宝可梦下场都无法改变，并且水属性招式无法使用。身高5.0m，体重999.7kg。可以学会招式断崖之剑。
原始盖欧卡是水属性宝可梦，特性始源之海（はじまりのうみ，Primordial Sea），可以制造暴雨天气，直到宝可梦下场都无法改变，并且火属性招式无法使用。身高9.8m，体重430.0kg。可以学会招式根源波动。
XY：妙蛙花、喷火龙（x y）水箭龟、胡地、耿鬼、袋兽、凯罗斯、暴鲤龙、化石翼龙、超梦（x y）电龙、巨钳螳螂、赫拉克罗斯、黑鲁加、班基拉斯、拉帝欧斯、火焰鸡、沙奈朵、大嘴娃、波士可多拉、恰雷姆、雷电兽、诅咒娃娃、阿勃梭鲁、烈咬陆鲨、路卡利欧、暴雪王。
欧米伽红宝石/阿尔法蓝宝石新增：拉帝亚斯、大针蜂、大比鸟、呆壳兽、大钢蛇、蜥蜴王、巨沼怪、勾魂眼、巨牙鲨、喷火驼、七夕青鸟、冰鬼护、暴飞龙、巨金怪、烈空座、长耳兔、艾路雷朵、差不多娃娃、蒂安希。
LPLE：妙蛙花、喷火龙、水箭龟、大针蜂、大比鸟、超梦、暴鲤龙、化石翼龙、呆壳兽、凯罗斯、耿鬼、袋兽、胡地。
在官方页面和超级进化环的广告中，曼迪曾把超级进化译为百万进化。
所有可以超级进化的宝可梦超级进化之后，其新名字都是在原名之前加上メガ，然而有两种宝可梦（大竺葵和远古巨蜓）的原名就带有メガ（分别是メガニウム和メガヤンマ），因此一时成为调侃的对象。
在游戏中，只有在本次开启游戏后主角第一次进行超级进化时才会出现完整版的动画，其它时候都是简要版的动画。
超级进化之后，HP的种族值不会发生改变，其他五项种族值不论增减，相加起来都比进化前多100，胡地是例外，因为在第六世代特防相比第五世代增加10的关系，使得超进化之后种族值合计只增加90。但是在第六世代同样增加了种族值的电龙没有出现此现象，因此胡地的情况可能是制作疏忽。
超级进化之后，只有物防、特攻、特防和速度的种族值可能下降，其中超梦Y（90→70）、蒂安希（150→110）的物防下降；电龙（55→45）、赫拉克罗斯（85→75）、勾魂眼（50→20）、喷火驼（40→20）、烈咬陆鲨（102→92）、暴雪王（60→30）的速度下降；大针蜂（45→15）是出现特攻下降情况的超级进化宝可梦；蒂安希（150→110）则是出现特防下降情况的超级进化宝可梦。
拥有性别差异的宝可梦（妙蛙花、胡地、暴鲤龙、巨钳螳螂、赫拉克罗斯、黑鲁加、火焰鸡、恰雷姆、烈咬陆鲨、暴雪王）在超级进化之后，性别差异会消失。
烈空坐是一只不需要超级石和钥石的宝可梦，并且不需要训练家就可以超级进化。只需学会画龙点睛。
在可以透过特性开启的四种天气之中，只有下雨无法通过超级进化启动，因为没有任何一只超级进化后的宝可梦的特性为降雨。
能够超级进化的宝可梦囊括了全部18种属性。
在第五世代就有超级进化的雏形：
在宝可梦黑2白2中出现了超级进化的雏形：好莱坞中某系列电影讲述主角制作了时间机器来到未来，发现未来人类被宝可梦当成奴隶，得知是因为虫属性宝可梦因为超级石而变得比人类智商还高，从而统治世界，最后主角改变了未来。