NERV也是不受法律约束的武装集团。表面上其任务是为了预防第三次冲击以及对使徒进行调查、研究、歼灭的工作，但其实质的目的是执行“人类补完计划”。其前身是在第二次冲击后创立的人工进化研究所GEHIRN（在德语中意为“脑”）。2010年，MAGI电脑系统完成后，改组为NERV（在德语中意为“神经元”）。最高执权者是基路·洛仑兹，最高司令官碇源堂，副司令为冬月耕造。本部位于第三新东京市日本箱根的地下，以下所属有战术作战、技术开发、特殊监督与保安谍报等部门。它在世界各国亦有诸多分部，是个跨国界的庞大组织。

在NERV标志的下面有半圈字，是“God's in his heaven. All's right with the world.”其出自Pippa's Song，为英国诗人罗伯特·勃朗宁（Robert Browning）所作，一般的理解是“神居于天，天下太平”， 也有人说它的引申意思是“神不为者，人为之”，体现了其最终补完人类的想法。但是Pippa's Song原作的意境中并没有体现出这种意思，有可能是他人为了贴合动画作品的思想而杜撰的解释。