康熙间原刊本，残存一、三、四、五，凡四卷。内封竖三栏，右栏偏上方镌“龙虎山张真人、南海别庵、绎堂二禅师鉴定”，中间题“三教同源录”，左栏偏上镌“仙真衍派、佛祖传灯、圣贤贯脉”，偏下篆字“包山林屋夫楼华藏版”条印。首《同原录序言》，尾署“时康熙庚辰（1700）长至日龙虎主人张继宗撰”，次普陀法雨寺主持性统序，普陀普济禅寺绎堂序，复次“康熙庚寅（1710）初夏翰林院检讨葑东，冯勖题于郊圃之石帆舫斋并书”序，又有自序，尾署“广颢选仙宣史徐道书于包山夫楼华藏”。序后有《说义十则》。

再后面是三教同原总目，分首、二、三集，首集“仙真衍派”（一至八卷）；二集“佛祖传灯”（卷九至十六）；三集“圣贤贯脉”（卷十七至二十二），除第二十二卷五节外，余皆卷九节。目录后有图像一百二十叶，勾勒颇生动。正文卷端题“新刻黄掌纶先生评订同原录”，署“林屋?夫楼秘本，江夏明阳宣史徐道述、汝南清真觉姑李理赞”，有眉批，旁批及总评【藏南京图书馆】又上海江东书局印行本二十四册。内封上横题《千古奇观》，中间直题《历代神仙通鉴》，旁署“龙虎山张大真人，包山黄掌纶先生同订”实际上卷九至卷十四及卷二十二是汪舜仪评订，卷十五、十六王掖宸评订，卷十七、十八及卷二十、二十一陈衷一评订。正文卷端题“新刻黄掌纶先生评订神仙鉴”，上标“林屋夫楼初本”（卷四、六、十三标“林屋石楼秘本”，卷十二，十四标“包山夫楼秘本”，卷十八至二十二标“包山夫楼原本”），下署“江夏明阳宣史徐道述，汝南清真觉姑李理赞”。卷十八至二十二署“新安融阳亦史程毓奇续，凤翔尚一贞王太素赞”。