《阵之书》原文记载，志村团藏为了实现自己对忍者的理想的需要，成立了暗部养成部门。这个组织位于木叶的影子底下，将树根深深扎进黑暗里，最大的目的就是在暗中消灭会妨碍村子繁荣的障碍。为此，他们执行任务时不择手段，这正象征着团藏的“忍之黑暗”，是一个无情且残酷的组织。

由于猿飞日斩在继任火影后没能有效延续二代目火影·千手扉间治理宇智波一族的基本方针，导致让团藏背负起了村子的黑暗，团藏由此获得以暗部培训部的名义成立了隶属于自己的独立组织“根”的权利。

在《疾风传·卡卡西暗部篇》中，“根”成员曾奉团藏之命，组建十人队伍执行对在九尾之乱结束后重新上任的三代 目火影实行暗杀，但由于曾被拉拢的旗木卡卡西的倒戈而失败。