丁曰健於1854年（咸丰4年）接替朱材哲，於台湾担任台湾府淡水抚民同知。台湾府淡水抚民同知又称淡水同知，为台湾清治时期的重要地方官员，官职品等为正五品，专司负责北台湾内政，为驻守於淡水厅的地方父母官。因为当时淡水厅管辖区域约今台湾基隆至新竹，因此实为北台湾的统治者。

1863年（同治2年），他则又奉旨前往台湾担任按察使衔分巡台湾兵备道，为台湾清治时期这阶段的地方统治者。

前任：

朱材哲 台湾府淡水抚民同知

1854年上任 继任：

唐均

前任：

陈懋烈 按察使衔分巡台湾兵备道

1863年上任 继任：

吴大廷