北京万里红科技有限公司成立于2001年，成立之初便整合了中国科学院软件研究所的优势技术资源。

2020年9月19日，北京东方中科集成科技股份有限公司（证券代码：002819）发布公告，将通过对万里红全体或部分股东以非公开发行股份的方式进行重组，成为万里红控股股东。东方中科作为电子测试测量领域领先的综合服务商，其控股股东为东方科仪控股集团有限公司，实控人为中国科学院控股有限公司（简称：国科控股）。至此，万里红正式开启回归中国科学院国科控股体系。

2021年9月17日，北京东方中科集成科技股份有限公司与北京万里红科技有限公司重组获中国证监会核准批复，正式回归中国科学院国科控股体系。

2022年，北京万里红科技有限公司发布了一款针对行业定制、搭载紫光展锐 T618 芯片和 OpenAtom OpenHarmony操作系统的平板电脑 —— 万里红平板电脑 SP10。