2021年9月28日14时，万顷沙站随广州地铁18号线首通段（万顷沙-冼村）正式开通试运营。

2022年9月，广州地铁在线网既有线路选取了万顷沙站对老式票亭进行“换脸”，升级为智能客服中心。

2023年9月10日，广州地铁通报，因配合外部施工需要，十八号线万顷沙站A、B口将于9月11日起封闭，同步启用C、D口，届时请乘客前往C、D口进出站。10月，南珠（中）城际万顷沙站盾构井顺利始发，标志着十万区间（十涌至万顷沙区间）盾构井至万顷沙区间左线盾构隧道开始施工建设。

2024年5月，南珠（中）城际十涌站至万顷沙站区间全面进入盾构施工掘进阶段。9月11日，南珠(中)城际铁路万顷沙站至十万区间盾构井区间隧道1号联络通道开始施工。