2012年6月，经国务院批准，撤销海南省西沙群岛、南沙群岛、中沙群岛办事处，设立地级三沙市，管辖西沙群岛、中沙群岛、南沙群岛的岛礁及其海域。三沙市人民政府驻西沙永兴岛。7月23日，三沙市第一届人民代表大会第一次会议召开，会议依法选举陈亚春为三沙市人民检察院检察长，并报海南省人民检察院提请海南省人民代表大会常务委员会批准。7月24日，最高人民检察院批复同意设立三沙市人民检察院。

2014年1月27日，三沙市三沙群岛人民检察院成立，是中国最南端的基层检察院。