更新时间：2022-06-25 13:02
上位基因（epistatic gene）指的是一对等位基因受到另一对等位基因的制约，并随着后者不同前者的表型有所差异。这一现象称为上位效应(epistasis)。起遮盖作用的基因如果是显性基因，称为上位显性基因。这种基因互作称为显性上位作用(dominant epistasis)。例如，影响狗毛色的显性白皮基因（I）对显性黑皮基因（B）有上位显性作用。在两对互作基因中，其中一对的隐性基因对另一对基因起上位作用。称为隐性上位作用(epistatic recessiveness)。例如，玉米(Zea mays)胚乳蛋白质层颜色的遗传。
例子
家兔中的灰兔和白兔杂交，子一代全是灰兔。子一代灰兔相互交配；子二代中有灰兔、黑兔和白兔三种兔出现，其比率为9︰3︰4。在9︰3︰4的比率中，有色（灰+黑）︰白色是3︰1；灰色︰黑色也是3︰1。出现了两个3︰1，这里包括两对基因之差。设一对基因为C、c，另一对基因为G、g，这两对基因共同决定兔毛的颜色。当显性基因C存在时，基因型GG或Gg的表型为灰色，gg的表型为黑色，当显性基因C不存在。而只有隐性基因c时，无论是GG、Gg的基因型，还是gg的基因型，其表型都为白色。
存在有两对非等位基因，其中一对中的显性基因（或隐性基因）可遮盖另一对非等位基因的表现，这样的两对基因的关系称为上位效应。上述例子中，是隐性基因c起作用，这种现象称为隐性上位作用。若发生显性上位作用，则后代中F2会出现12︰3︰1的分离比。