上水惠州公立学校由上水惠州同乡会有限公司於1956年创办，初期为义学性质，1959年9月正式接受政府津贴，成为一间政府津贴小学，并分上、下午班，招收男女学生。经过1960至1965年间的努力耕耘，上水惠州公立学校渐渐建立良好校誉。1970至1978年间，上水惠州公立学校升中派位成绩理想，学生获派港九著名中学就读者，大不乏人，深得家长信赖和称誉。1984年9月，上水惠州公立学校获教育署批准迁入彩园。

2003年11月，上水惠州公立学校获教育统筹局分配一所30班新型校舍。新校舍位於上水天平路51号，建筑费达九千八百万元。2008年9月，上水惠州公立学校迁往新校舍继续办学，校舍设备充足，有三十个课室、大礼堂、多用途教学室、电脑辅助教学室、英语活动室、视觉艺术室、常识室、语言学习室、音乐室、图书馆、学生活动中心及两个标准篮球场，可提供更优质的环境让上水惠州公立学校学童学习。