2019年6月19日，上海中医药大学中西医结合研究院成立大会暨揭牌仪式在上海中医药大学全球合作伙伴中心学术报告厅隆重举行，为了发挥中西医结合学科人才与资源集聚效应，有效地发挥中西医结合学科在建设中的平台支撑和引领辐射作用，打造中西医结合学科建设创新示范基地。新中国成立后我国中西医结合事业取得很大进步，上海中医药大学是新中国最早成立中西医结合学科的院校之一，在教育部全国第四轮学科评估中，中西医结合学科与中医、中药同时获得A+。

上海市卫生健康委员会副主任、上海市中医药管理局副局长张怀琼，上海市中西医结合学会会长、海军军医大学长海医院教授凌昌全，该校党委书记曹锡康、校长徐建光共同为中西医结合研究院揭牌。

以国家科技、卫生发展规划、社会重大需求为导向，坚持 “国际化、现代化、继承，创新”的指导思想；立足于中医药发展和国家科创中心建设要求；坚持自主创新与国际合作相结合、基础研究与临床相结合、中医学与现代科学相融合的建设方针，以建设一流的医学中心为目标，创新中西医结合学科的运行体制，推进中西医结合的科学研究和学科人才培养；搭建基础医学与附属医院的临床学科的合作平台和运行机制。研究院将聚焦中医药防治疑难重大疾病、中医核心理论的科学内涵、中西医结合关键科学问题等方向，充分发挥学科、人才、平台的优势，联合攻关，形成标志性成果，打造一流的学科和人才队伍。