“中心”旨在加强和扩大上海市与中国工程院的联系与合作，落实上海市人民政府和中国工程院合作委员会确定的各项工作和任务，充分发挥在沪院士及各学科专家的优势，对上海市及有关地区的经济建设、社会发展中的重大工程科技问题、发展规划、计划、方案及其实施等提供咨询；活跃国际和国内的学术活动，承办科技论坛；加快青年科技人才的成长；做好在沪院士的联络和相关服务。

“中心”主任由中国工程院院士翁史烈担任，执行主任由中国工程院院士杨胜利担任，三名副主任分别由施强华、阮宝君和杨晓秋同志担任。“中心”聘任上海市发改委、经委、教委、科委、建委、市委组织部知识分子工作处、市人事局留学人员办公室等单位相关领导作为“中心”兼职副主任。

“中心”下设办公室，学术活动部，项目管理部。