学院大力开展科学研究，重视企校合作，建有虚拟现实实验室、水运系统决策技术与评价重点实验室、现代港口综合实验室、数字物流实验中心实验室、码头自动化控制实验室、交通工程实验室、FFA实验室等科研平台，科研成果丰硕。

学院早在1983年就与亚太经社会合作培养航运研究生班，近年又与世界海事大学、西澳大利亚大学合作培养研究生，与中西非地区海事大学合作开办物流管理本科专业，与香港理工大学、美国麻省海运学院、韩国仁荷大学建立互换学者及学生的交流机制。

国航系成立前的演变脉络：1958年在武汉水运工程学院举办远洋运输业务专业两个班，1959年上海海运学院成立后于1962 年在上海海运学院航海系筹建远洋运输业务专业并招生，1963年运洋运输业务专业归属水运经济系，1965 年从水运经济系分出设立远洋运输业务系。

1965年成立远洋运输系，下设远洋运输业务、英语、法语专业。

1972年-1976年远洋运输系，下设远洋运输业务、国际邮政通信进修班（1994年停办）、英语师资班专业。

1977年-1984年远洋系，下设远洋运输业务专业。

1985年-1987年国际航运系，下设国际航运、国际经济法专业。

1988年-1992年国际航运系，下设国际运输管理、国际经济法专业。

1993年-1996年国际航运系，下设国际企业管理（国际航运）、国际经济法、国际运输管理（国际集装箱运输专科）专业。

1997年国际航运系，下设国际企业管理（国际航运）、国际经济法、交通运输管理（国际集装箱运输）、交通运输管理（国际集装箱运输专科）专业。

1998年国际航运系，下设国际企业管理（国际航运）、国际经济法、交通运输管理（国际集装箱运输）、交通运输管理（国际集装箱运输专科）专业、国际金融（保险）专业。

1999年-2001年国际航运系，下设旅游管理、工商管理（国际航运）、工商管理专业。

2002年-2003年国际航运系，下设工商管理（国际航运）专业。

2004年-2012年国际航运系，下设航运管理专业。

2013年-国际航运系，下设交通管理（航运管理）专业。

管理系成立前的演变脉络：1950年东北航海专科学校成立航务管理科、1951年东北航海学院航运管理系、1952年中南交通学院的航运系，1953年大连海事大学海运管理系，1957年武汉水运工程学院水运管理系。

1959年上海海运学院成立，1962年上海海运学院设立海运管理系，后更名为水运管理系。

1962年-1966年水运管理系下设水运管理专业。

1977年-1984年水运管理系下设水运管理工程、水运经济、水运财务会计专业。

1984年-1987年水运管理系下设水运管理工程（交通运输管理工程）专业。

1988年-1992年水运管理系下设交通运输管理工程（水运管理）专业。

1993年-1994年管理系下设水运管理、水运管理（专科）、国际企业管理、旅游管理（专科）。

1995年管理系下设水运管理、国际企业管理、旅游管理（专科）。

1996年管理系下设水运管理、国际企业管理、旅游管理。

1997年管理系下设水运管理、国际企业管理。

1998年管理系下设水运管理、国际企业管理、国际企业管理（专科）。

1999年管理系下设交通运输。

2000年管理系下设交通运输、港口航道与海岸工程。

2001年管理系下设交通运输、物流管理、港口航道与海岸工程、船舶与海洋工程。

2002年-2008年管理系下设交通运输、物流管理、港口航道与海岸工程、交通工程。

2008年-管理系下设交通运输、物流管理(2008年4月港口航道与海岸工程专业调整到海洋环境与工程学院，2008年12月交通工程专业变更为交通工程系)。

交通工程系前身为交通运输学院管理系交通工程专业。

2002年交通运输学院成立，下设管理系及国航系、法律系，管理系下设交通运输、物流管理、港口航道与海岸工程、交通工程专业。

2002年交通工程专业开始招生，2002年-2007级招生人数一个班。

2008年交通运输工程专业，2008级开始招两个班。

2008年12月交通工程专业组建为交通工程系。

交通运输、国际航运管理为学校的特色专业。1986年交通运输、国际航运专业被列为上海市重点专业，1988年交通运输规划与管理被列为交通部重点学科。交通运输规划与管理学科于2007年和2008年先后被国家教育部和上海市教委批准为国家重点（培育）学科和上海市教委重点学科。航运管理、物流 管理被列为国家特色专业。2008年物流管理及航运管理专业两个特色专业获上海市本科教育高地建设项目资助专业。交通运输学院现拥有交通运输规划与管理博士学位授予权，在校博士生达20余名；交通运输工程与交通运输规划与管理2个硕士点，国际航运与物流工程与物流工程与管理2个中外合作研究生培养项目，共培养在读硕士研究生500余名；交通运输、航运管理、物流管理、交通工程四个本科专业，在读学生2000余人。“国际航运管理”课程获国家级精品课程，“仓储与配送”课程获上海市精品课程。“物流管理”与“航运管理”专业均为国家级特色专业建设点。

上海海事大学交通运输学院作为全国最早创立交通运输工程专业及第一批硕士点院校之一，积累了半个多世纪的人才培养与学科研究的丰厚经验，逐步发展成为我国从事交通运输（水运管理）专业教学与研究的主要基地。

学院学科体系完整，人才培养层次齐全，在校全日制研究生300人，本科生2400人。其中交通运输规划与管理学科于2007年和2008年先后被国家教育部和上海市批准为国家重点（培育）学科和上海市重点学科。物流管理、航运管理专业为国家级特色专业，交通运输、航运管理、物流管理被列为上海市本科教育高地。

2018年10月26日，被教育部遴选为首批“三全育人”综合改革试点院（系）之一。

交通运输工程学科群是上海海事大学的强势学科，作为交通运输工程一级学科下的二级学科，交通运输规划与管理学科自1981年起培养硕士学位研究生，1997年成为交通部重点学科，1998年获得博士学位授予权，2007年被列为国家重点(培育)学科，2008年成为上海市重点学科。长期以来，交通运输规划与管理学科以港航领域中的重大理论、技术和管理问题为主攻方向，科研工作成绩显著，并取得了明显的社会经济效益。学科未来的发展目标是：建设能承担基础与应用研究的、与国家水运事业和上海国际航运中心建设密切相关的国家工程中心和交通行业重点实验室，在科学研究和人才培养等方面取得为国际同行所公认的创新性成果和领导地位，最终成为具有国际先进水平和航运特色的国家级重点学科。

学院拥有一支结构合理的师资队伍，共有专任教师67名，特聘东方学者2人，教授14人（含博导5人），副教授25人。教师中已具有博士学位和正在攻读博士学位的人数占学院教师总数的72%。

学院大力开展科学研究，重视企校合作，建有虚拟现实实验室、水运系统决策技术与评价重点实验室、现代港口综合实验室、数字物流实验中心实验室、码头自动化控制实验室、交通工程实验室、FFA实验室等科研平台，科研成果丰硕。

学院早在1983年就与亚太经社会合作培养航运研究生班，近年又与世界海事大学、西澳大利亚大学合作培养研究生，与中西非地区海事大学合作开办物流管理本科专业，与香港理工大学、美国麻省海运学院、韩国仁荷大学建立互换学者及学生的交流机制。

学院招生包括交通运输、交通管理、物流管理、交通工程4个本科专业，其中交通管理（航运管理）为文理兼收专业，交通运输类和物流管理为理工科专业。

交通管理专业

交通管理（航运管理）专业为国家级特色专业、上海市本科教育高地，旨在培养精通国际航运商务、国际航运经营管理知识，熟悉国际贸易与国际运输实务，英语水平高，具有海内外独立工作能力的国际航运、综合物流等相关企事业单位及政府行政部门、科研院所、国际组织所急需的高级航运管理人才。交通管理（航运管理）专业2015年录取平均分排名我校第一，调剂率为0，文史类录取最高分数平均超27个省市一本分数线44.15分，理工类录取最高分数平均超27个省市一本分数线62.59分，全国开设此专业的仅有上海海事大学、大连海事大学、中国民用航空飞行学院、重庆交通大学和山东交通学院5所高校，特色显明，我校交通管理（航运管理）专业在5所高校中录取分数排名第二。

交通运输大类

交通运输类专业包含交通运输和交通工程两个专业，其中交通运输专业是我校1959年恢复办校后开办的第一批专业（原水运管理专业），先后被列为上海市重点专业、交通部重点学科、国家重点（培育）学科、上海市本科教育高地项目、上海市“085工程”重点建设专业、上海市“专业综合改革试点”项目和教育部地方高校第一批本科专业综合改革试点专业。该专业作为上海海事大学的传统优势专业，经过大半个世纪的积淀与传承，现已发展成为从学士到博士、再到博士后科研流动站等完整的人才培养体系，长期以来培养了大批港口、航运、物流等在内的交通运输相关工程技术领域管理和实践等方面的人才，在我国港口和航运领域以及上海国际航运中心和中国（上海）自由贸易试验区建设和发展中发挥着巨大的作用。

物流管理专业

物流管理专业为国家级特色专业、上海市本科教育高地，旨在培养掌握多领域的专业知识，熟练掌握国际物流知识、物流组织管理和工程技术，拥有较强实践能力的综合物流管理人才。物流管理专业2015年录取平均分排名我校第四，调剂率为0，理工类录取最高分数平均超27个省市一本分数线47.63分。

交通运输规划与管理

交通运输规划与管理学科立足上海海事大学特色，是交通运输学院的主体学科。主要研究港口、航运、物流以及综合交通领域相关的理论、方法和技术，以满足交通运输在效率、经济、节能、环保、安全等方面目标要求。交通运输规划与管理学科1981年获硕士学位授予权，1998年获博士学位授予权，1996年被评定为交通部重点学科。该学科的科研水平在国内领先。近年来，先后承担过国家自然科学基金项目，省部级项目以及各类横向项500多项，其中一部分项目达到国家先进水平。

交通运输工程

上海海事大学交通运输工程专业立足上海海事大学特色，是国家“一带一路”和上海五个中心建设急需的高等级技术和管理人才的重要培养基地。交通运输工程与交通运输规划与管理学科渊源很深，交通运输规划与管理1981年获硕士学位授予权，1998年获博士学位授予权，1996年被评定为交通部重点学科。学校现拥有交通运输工程一级学科博士学位授予权及博士后流动站，在校全日制研究生近300人。近年来，承担的国家级科研项目、省部级科研项目以及各类横向项目达500余项，其中一部分项目达到国家先进水平。本专业分交通运输学院和商船学院两个分支。

交通运输工程专业交通运输学院分支侧重研究交通运输、国际航运、物流、交通工程以及多式联运等领域规划、设计、控制、管理等方面相关的理论、方法和应用技术，以满足交通运输在效率、经济、节能、环保、安全等方面目标要求。学院学科体系完整，人才培养层次齐全，学院拥有一支结构合理的师资队伍，共有专任教师近百名，教师中已具有博士学位和正在攻读博士学位的人数占学院教师总数的86%。学院大力开展科学研究，重视企校合作，建有虚拟现实实验室、水运系统决策技术与评价重点实验室、现代港口综合实验室、数字物流实验中心实验室、码头自动化控制实验室、交通工程实验室、FFA实验室等科研平台，科研成果丰硕。