2013年5月11日，上海科技大学新校区工程开工仪式在浦东科技园校园建设工地举行，上海科技大学校园工程建设进入施工阶段。7月8日，上海科技大学2013“走进科研体验创新”大学生夏令营正式开营。8月9日至11日，上海科技大学首届高中生夏令营举行。9月3日，上海科技大学首届研究生开学典礼在中科院上海浦东科技园举行。9月25日，上海科技大学与美国安进生物技术公司签订战略合作备忘录，双方协定在上海科技大学校园内设立安进中国生物医药研发中心。

2013年9月30日，教育部批复同意正式建立上海科技大学。12月，上海科技大学iHuman研究所举办第一届上海GPCR论坛。2013-2016年，上海科技大学依托中国科学院大学联合招收和培养硕博连读和硕士研究生。

2014年1月，教育部批准上海科技大学2014年本科招生方案。2月，上海科技大学首任校长江绵恒、党委书记朱志远正式任命。6月18日，上海科技大学与芝加哥大学签署合作备忘录，双方协定将在科研、学术、文化教育等方面开展全面合作。9月30日，上海科技大学举行首届本科生暨2014级研究生开学典礼。11月，安进亚洲研发中心落户上海科技大学。

2015年4月，上海科技大学宣布与美国南加州大学电影学院启动全面合作。9月23日，校长江绵恒一行访问麻省理工学院并签署学生培养合作协议。

2016年4月，国务院发布《上海系统推进全面创新改革试验加快建设具有全球影响力的科技创新中心方案》，明确指出上海科技大学要发挥体制机制优势，参与上海张江综合性国家科学中心建设。学校与中科院上海应用物理研究所、上海光学精密机械研究所等单位合作，牵头或参与建设软X射线自由电子激光用户装置、活细胞结构与功能成像等线站、超强超短激光实验装置、光源二期等重大科技基础设施，上述项目于2016年11月开工。同年4月11日，上海科技大学与复旦大学签署合作框架协议。

2017年5月，学校通过了上海市学位委员会的本科专业授权评审，获得了物理学、化学、生物科学、材料科学与工程、电子信息工程、计算机科学与技术6个本科专业的学士学位授权。7月，入选国家第二批“大众创业万众创新”示范基地。12月15日，上海科技大学作为项目法人单位，总投资近百亿元的国家重大科技基础设施项目——“硬X射线自由电子激光装置”获批启动。同年，经教育部同意，学校结合上海科创中心和上海市国家级教育综合改革试验区建设，自2017年起开展“高水平研究生教育综合改革试点项目”，在7个一级学科（生物学、材料科学与工程、计算机科学与技术、物理学、化学、电子科学与技术、信息与通信工程），以硕博连读方式独立招收研究生。

2018年2月1日，学校与上海交通大学签署合作框架协议。4月，学校与IBM签署新工科建设与创新创业人才培养教育合作协议。6月16日，上海科技大学2018届毕业典礼暨学位授予仪式举行，首届199名本科毕业生、150名2018届联培硕士研究生、首届41名联培博士研究生毕业；同月，首批入选上海高等学校一流本科建设引领计划。同年，国务院学位委员会批准上海科技大学成为博士学位授权单位并获批“材料科学与工程”一级学科博士学位授权点。

2019年4月30日，首批入选上海高等学校一流研究生教育引领计划。5月，上海科技大学、美国费城交响乐团和上海爱乐乐团签署三方合作协议。2019年至2021年间，物理学、计算机科学与技术、生物科学、材料科学与工程、电子信息工程专业相继入选“上海市一流本科专业建设点”。

2020年7月，计算机科学与技术、电子信息工程专业同时入选“上海市级新工科研究与改革实践项目”。

2021年4月29日，由上海市人民政府批准设立的研究型医院“上海临床研究中心”在上海科技大学揭牌成立。7月31日，上海科技大学与荷兰皇家壳牌公司签订战略合作协议。10月，由中科院上海高等研究院、中科院上海应用物理研究所共建的“上海科技大学2060研究院”成立。同年，计算机科学与技术入选国家级一流本科专业建设点。

2022年2月14日，上海科技大学入选全国第二轮“双一流”建设高校名单，是上海唯一新增的一所“双一流”高校，“材料科学与工程”学科列入一流学科建设名单。

2023年9月28日，上海科技大学召开建校十周年科教融合创新发展大会。11月，上海科技大学与华人运通控股(上海)有限公司（高合汽车）签署战略合作协议。同年，学校新增获批“智能感知与人机协同”教育部重点实验室，作为依托单位之一获批新建“先进医用材料与医疗器械”全国重点实验室。

2024年5月，上海科技大学与上海市精神卫生中心签署合作协议。7月，上海科技大学与上海联和投资有限公司、徐汇区博士后创新实践基地三方合作签约仪式和签约授牌仪式举行。

截至2024年6月，上海科技大学下设学院、书院、研究院所、科研中心等19个。本科招生专业12个，涵盖物理、化学、材料、生物、信息、管理、创意与艺术、数学、历史等。

2022年，上海科技大学6个学科进入ESI学科排名前1%。截至2024年6月，上海科技大学有博士学位授权一级学科5个，硕士学位授权一级学科8个；博士专业学位授权类别2个，硕士专业学位授权类别3个。

截至2023年7月，上海科技大学已选聘常任轨教授342位、教学教授29位、特聘教授288位，其中包括诺贝尔奖获得者4位、中国科学院院士33位、中国工程院院士5位、美国国家科学院院士10位、美国人文和科学院院士8人、英国皇家学会院士2位。截至2023年12月，上海科技大学教职工总数1522人，其中常任教授序列和教学教授序列教师376人、特聘教授序列教师288人。

上海科技大学本科生培养遵循“宽口径、厚基础、小规模、国际化”原则。研究生培养注重结合重大科学设施、重大科研项目和重点产业，立足学校定位和特色培养国家战略急需人才。截至2022年，上海科技大学共有国家级一流本科专业建设点1个，省级一流本科专业建设点4个。4门课程被认定为2022年度上海高等学校一流（线下）本科课程。2023年，学校共获批市级课程/教改类项目11项、获得市级教学设计类奖项1项；校级精品课程建设项目立项12项（本科）、校级优秀教改建设项目立项4项（本科）、校级教材建设项目立项5项。

上海科技大学致力于与国际知名大学建立友好务实的合作关系，在外语教育、课程设置、多元文化教育、师生交流、联合培养、科研合作、创新创业等方面进行试验和改革，以培养高素质的国际化人才。截至2024年6月，上海科技大学已经与加州大学伯克利分校（University of California Berkeley）和芝加哥大学（University of Chicago）和签订了校际合作备忘录，并与麻省理工学院（MIT）签订了学生培养合作协议，在课程开发、教师进修和学生交流等方面开展合作。

截至2024年6月，上海科技大学有国家第二批大众创业万众创新示范基地、活细胞结构与功能成像等线站工程、上海市高分辨电子显微学重点实验室、上海智能视觉影像及应用工程技术研究中心、上海高能效与智能定制芯片工程技术研究中心5大科研基地。还有“智能感知与人机协同”教育部重点实验室，作为依托单位之一获批新建的“先进医用材料与医疗器械”全国重点实验室。并与中国科学院上海分院所属各研究院所签署了全面合作协议，学校与各研究院所的教育资源、科研设施、技术平台等相互开放，资源共享，优势互补。

截至2023年，上海科技大学科研人员共参与发表科研论文13468篇，其中第一作者或通讯作者论文8799篇，以第一作者和通讯作者单位在Nature、Science、Cell、Adv. Materials、Cell Stem Cell、JACS、Angew. Chem. Int. Ed.、Nat Comm.、TPAMI、PRL等领域代表期刊上发表论文逾1000篇。在《科学》《自然》《细胞》期刊发表第一作者单位论文26余篇。科技成果转化成效显著，专利许可合同金额位居全国高校前列。研究成果连续四年入选“中国生命科学十大进展”。

截至2023年9月，上海科技大学馆藏纸质图书14.6万册，电子图书284.6万册，生均图书（含电子）344册/生，生均年进书量（含电子）26册/生。中外文数据库合计172种，电子期刊24192种，学位论文1306万篇。信息资源利用率持续提高，2022年图书流通量2.78万册，电子资源访问量395.78万次。

《材料研究述评》（Accounts of Materials Research，AMR），2020年10月创刊（月刊），是上海科技大学主办的首个国际学术期刊，由上海科技大学与美国化学会共同出版，2020年获“中国科技期刊卓越行动计划高起点新刊项目”支持，相继被ESCI、Scopus数据库收录。AMR主要发表简明扼要的述评文章，概述材料科学和工程各领域的基础和应用研究；也发表前瞻性观点。AMR致力于促进材料领域内不同分支的交融、助力全球材料科学与工程的发展和材料人的成长，与美国化学会综述期刊Accounts of Chemical Research和Chemical Reviews一起组成新的高影响力综述期刊平台。

上海科技大学校徽核心图案由“塔”“翼”“环”三部分组成。核心图案设计中融入了学校下设三个学科领域的代表性元素，其中晶体结构代表物质科学，波形/频谱代表信息科学，质粒环状DNA代表生命科学。校徽中还包括了中英文校名、育人理念和建校时间。

上海科技大学的校训是“立志、成才、报国、裕民”。

截至2023年2月，上海科技大学承文艺之志，书人生风采，以兴趣为驱动，成立了丰富多彩且颇具专业性和特色的文艺社团。有管弦乐团、风禾剧团、国风民族文化社、音乐社、尘音合唱团等。

上海科技大学管弦乐团成立于2016年11月，含弦乐、管乐、打击乐、键盘等声部，成员来自各个学院热爱音乐的同学和部分校外音乐爱好者，是全国为数不多完全由学生自主管理的乐团。乐团指挥由上海音乐学院指挥系潘文爽老师担任。 自创立以来，乐团累计举办专场音乐会7场，参与校内外演出50多场，活跃在学校毕业季演出、元旦晚会等场合。

上海科技大学风禾剧团成立于2021年。剧团积极参加上海高校之间的话剧交流活动，同时也给上科大师生奉献精彩的演出。风禾剧团在2021年举办了欢乐的破冰活动，并且在新年晚会中排演了话剧《地下交通站》，获得了上科大师生的一致好评。

国风民族文化社成立于2014年，有国风民族乐团、国风民族舞团和古风综合部三个主要分部。乐团和舞团组织定期训练，参与校内外演出；古风综合部不定期组织传统节日、茶道香道、汉服等传统文化相关体验活动。

截至2023年12月，上海科技大学有浦东校区和岳阳路校区两个校区，校园占地约900亩，总建筑面积约70万平方米。

浦东校区位于上海市浦东新区华夏中路393号，是建设中的张江综合性国家科学中心的重要组成部分，与张江实验室、上海同步辐射光源、国家蛋白质科学研究（上海）设施等国家级科研机构和大科学设施融为一体。

岳阳路校区位于上海市徐汇区岳阳路319号8号楼。

上海科技大学最具特色的建筑是景观塔，它是学校内最高最独特的建筑物，它的设计灵感来自始建于北宋年间的松江方塔，设计者以玻璃和钢为材料，在细节上再现中国传统建筑的细节。