中国亚太经济合作中心旨在促进中国与世界各国的经济、技术的交流与合作；已与世界多个国家建立了友好合作关系，并在境外设立了多个分支机构。

中国亚太经济合作中心一直致力于促进中国与世界各国经济贸易的发展，主要从事国际贸易、国际经济合作、外国投资、多双边援助、世界和地区经济贸易、中国对外经贸战略及中国贸易发展等的政策和研究，传递和发布国内外经贸信息，参加和组织贸易与投资促进报告会、洽谈和交流活动，开展经贸信息服务和招商引资工作，负责本中心驻外代表处的业务协调与管理。

中国亚太经济合作中心主要职能部门有：国际贸易发展中心、国际交流与合作中心、对外经济贸易中心、国际金融中心、市场运行调节处（运行处）、法规处、外资综合处、外商投资企业管理处(外企处)、世界贸易组织处(世贸处)、信息化处(信息处)、外事联络处(外事处)、安全监管处(安监处)、项目报批中心、宣传出版中心、资产管理中心、机关服务中心、经济信息部、财务部、人事部等。