云南省军区成立于1950年4月1日，隶属中国人民解放军西南军区建制。辖滇南、滇西、曲靖、宜良、玉溪、楚雄、武定军分区。

1955年4月改编为中国人民解放军昆明军区兼云南省军区。

1957年8月，另行组建云南省军区机关，隶属昆明军区。

1985年8月，成都军区与昆明军区合并为新的成都军区后，云南省军区归中国人民解放军南部战区建制。

2016年1月，省军区系统转隶划归军委国防动员部管理，云南省军区相应划归中央军委国防动员部管理。

郑仲全：中国人民解放军云南省军区少将政治委员。