全书共选写九百零六种医籍提要。全书所选医书俱分基础理论(包括医经、诊断、本草、方书、伤寒、金匮、温病)、临床各科(包括内、妇、儿、外、五官、伤、针灸、按摩诸科)、综合(包括综合性医书、医案、医话、医论、丛书、全书)，以及医史、法医、养生等四大类，每类皆以成书年代先后为序。每种书目下首先注明成书年代，若成书年代无考者则取最早刊行年代；次标明作者及其主要生存朝代；再次为内容提要，叙述其卷目章节、内容要点、学术成就、学术思想、源流及对后世的影响。作者生平传略置于本书最先出现其著作的提要中，后见者从略；末为版本；若为丛书，并分列其子目。是书重点，主在提取诸医籍之学术精要。书末附有书名索引和人名索引。