学院制定了“一个目标、两个计划、三个体系、四个支撑”的战略发展思路，选拔海洋科学及相关学科的拔尖研究生进行培养，以“立德树人，学科交叉，科教融合”为导向，实施高层次交叉学科人才培养“合金计划”、“三强计划”，采取“本硕博”无缝隙对接培养模式，建立国际一流、交叉融合式的海洋科学课程教学体系和交叉融合式科研指导体系，设立交叉培养指导委员会、学科交叉导师委员会，实施跨学科轮转学习和轮转培训，创建交叉思维范式、创新跨学科变轨动态机制，开展多学科多方向研究、前沿讲座、研究生多学科交叉研究前沿论坛等学术与交流形式，发挥多学科优势，从创新性、交叉性、复合性等多方面提升研究生的科研能力与水平，培养造就学科交叉的创新性、复合型高层次顶尖人才。

学院打造了海洋领域世界一流的学术活动“未来海洋讲坛”，开设了十余门高水平、国际化研究生课程，包括国内首门海洋类文理交叉研究生公共选修课《经略海洋》（吴立新院士领衔，共21位一流专家组成的教授“天团”）、国内首门“全球海洋公开课”、国内首门面向海洋科学研究生的人工智能课程《人工智能与大数据分析》等。