中央纪委案件监督管理室主要负责集中管理干部问题线索、统一受理下级纪检监察机关线索处置和案件查办报告、归口管理查办案件工作中与有关部门的联系协调事项、监督检查纪检监察机关依纪依法安全办案情况等。