乾隆二十三年(1758)自巴里坤移置，驻迪化城(今乌鲁木齐)，总理乌鲁木齐提标四营及玛纳斯、吉木萨、库尔喀喇乌苏(今乌苏)、精河、巩宁城守、喀喇巴尔噶逊营、巴里坤绿营事务。下辖中军参将1员，守备1员，千总2员，把总4员，经制外委5员，马步兵944名。光绪十一年(1885)徙喀什噶尔(今喀什)，更名喀什噶尔提督。