温度：保护区年平均温度16.4℃，比县气象站低2.5℃

降水：保护区年平均降水量2155.6 mm ，县气象站为1522.8 mm，保护比县站多632.8 mm.

蒸发量：保护区年蒸发量790.2 mm，而县气象站为1391.1 mm。保护区的年降水量比蒸发量多1365.4 mm.

湿度：

保护区多年平均相对温度为87%，比县站的80%高出7个百分点。

日照：保护区平均日照1069.5小时，比县气象站少655.7小时。

保护区森林覆盖背地达94.7%，核心区森林覆盖编者98.2%，天然植物被保存完好，水源涵养效益高，水源丰富，沟谷溪流终年流水潺潺，是赣江上游主要支汉桃江的源阔大地区，区内主要河流有大丘田、饭罗河、鹅公坑河等8条河流。

保护区地质构造复杂，成土母质多样，植被类型丰富，成土过程因地形、母质和植被的差异而不同，土壤的水平和垂直分布规律性相当明显，在南岭山地具有代表性。按海拔高度自上而上依次分布有山地红壤、山地黄红壤、山地黄壤和山地草甸圭。

九连山植物丰富，植被类型多样，从海拔280m的丘陵到海拔1000m以上的山地，具有多种不同的植被类型分布，其区系组成也迥然不同。自然保护区主要的植被类型有常绿阔叶林、针叶林、竹林、山顶矮林、灌木草丛以及湿地植被。可分为26个群系55个群丛。

2023年3月15日，九连山保护区科研人员在江西九连山首次发现浙闽龙头草。

保护区总体上属于中一低山地貌。最高峰黄牛石海拔1430m，最低海拔280m，最大相对高差1150m，一般相对高度也达600－800 m。由于区内地质构造背景复杂，地质小单元多且差异极大，构造具多方向，由此控制着区内微地貌小单元的多样性和地貌形态上的差异性。全局地貌大致具有盆领相间、棋盘格状展布之格局，这与构造局基本吻合。也与地层及岩性条件密切相关。

九连山在大地地构造上属“南岭纬向构造带”东段与武夷山北东向构造南段的复合部位西侧，属于“九连山隆起构造带”九连山保护区位于多向构造系统环境中的隆起地质构造背景之上。区内出露的地层有寒武系的浅变质的板岩、千枚岩、变余砂岩；泥盆系厚层状石英质砾岩等；石炭系的钙页岩等；在河谷有第四系地层出露。保护区内岩石种类较多，分布最广的是岩浆岩类黑云花岗岩；泥岩；砂岩等海相沉积岩类分布区约占保护区面积1/3，还分破财有变砂岩、板岩等沉积变质岩；而陆相红色碎屑岩也有分布，这类岩石以其特有的颜色和岩性特点，形成独特的地貌景观—丹霞地貌。

保护区南北长约17.5Km，东西宽约15Km，分为核心区、缓冲区和实验区三个功能区，总面积13411.6h㎡。

保护区的主要职能是保护九连山野生动植物资源和开展科学研究。保护区内现已查明的高等植物有2796种；脊椎动物384种，其中鸟类236种；昆虫19目1404种。其中列入濒危野生动植物种国际贸易公约名录的野生动植物有118种，占江西省一半以上，有被称为现代蝶中大熊猫美誉的国家一级保护动物——金斑喙凤蝶，有世界极度濒危、中国独有的海南虎斑鳽（yàn），有世界十大濒危物种之一、癌症的克星、国家一级保护植物南方红豆杉。早在1987年，保护区植物标本馆就被列入《中国植物标本馆索引》。

野生植物有145科1100多种，其中苔藓植物有10科30种，蕨类植物24科62种，种于植物中裸子植物9科16种、被子植物152科1000多种。主要科属为壳斗科栲属、青冈属、石楝属、山毛榉属，樟科的润楠属、储木属、樟属、琼柄属、厚壳楠属、山胡椒属、木姜子属，木兰科的木莲属、含笑属、木兰属，山茶科的山茶属、柃木属，其次还有枫香科、桃金娘科、金缕梅科、大风子科、野茉莉科、冬青科、灰木科、杜英科等一些属、种。顶级植被类型为常绿阔叶林。由于地处过渡地带，热带延伸过来的种类不少，热带性科约60个，有香荔枝科、天料木科、桑科等。

植物垂直分异明显：常绿阔叶林带分布于海拔280一1000米的沟谷至山顶范围，主要有黄端木林、木荷林、青冈林、南岭栲林、米储林、按树林、甜储林、罗浮栲林、粤佳石袜林、曼青冈林、红榜林等，针叶林（主要有马尾松林）分布于海拔280一1000米的山脊，杉木林散生于海拔300一1000米的常绿阔叶林中，南方红豆杉林分布于海拔500——1000米的沟谷缓坡常绿阔叶林中，常绿、落叶阔叶混交林带，主要分布在海拔800米以上的山坡上常见的常绿树种有米储、木荷、鹿角栲、榉等，落叶树种有拟赤杨、泡花树、光皮树、浙江柿、枫香等；山顶矮林带分布在梅拔1000米以 上的山顶、山脊和陡坡上，生长低矮、干形弯曲、遍布苔藓，主要由杜鹃花科、壳斗科、竹科物种组成。此外，在山地、丘陵局部地区分布有次生性的芒箕群丛、五节芒群丛、芒草群丛等构成的亚热带草甸，成分组成以禾本科的芒草、野古草属、金茅属等的物种组成。属国家保护植物有伯乐树、杜仲、银杏、鹅掌楸、观光木等12种。

保护区陆生脊椎动物40科57属 59种，其中兽类12科20属24种、鸟类17科19属23种、爬行类7科13属16种、两栖类4科5属6种。鱼类有5科10属10种，蝶类有108种。动物地理分区属VIA。属国家保护动物一级有海南虎斑鳽、金斑喙凤蝶、蟒蛇、黄腹角锥、螃，二级有大灵猫、小灵猫、水鹿、损羚、荫、水獭、穿山甲、白鸥、鸳鸯等。

1、大量恐龙时代植物

2002年在江西龙南县九连山自然保护区内惊喜地发现了面积约500平方米、数量约百余株的恐龙时代植物——粗齿桫椤。在江西南部首次发现如此众多且密集分布的桫椤。九连山发现粗齿桫椤，为研究南岭山地的古植物学、古气候学和古地理学提供了极其珍贵的科学依据。

2、伞花木群落

中国专家在江西省九连山保护区开展伞花木资源调查及遗传学分析时，在保护区核心区某沟谷中发现了成片分布的伞花木群落。该沟谷呈东南走向，海拔自五百一十七至六百四十一米，群落面积一百零三点一公顷，分布有伞花木约二百三十株，是江西省发现的最大的伞花木群落。

伞花木属无患子科落叶乔木，雌雄异株，为中国特有，是国家二级保护植物。

森林漫步

在靠近公路的原始林区，辟有巡山道路600多米，供游人深入林间，欣赏奇景。

趣味垂钓

这里野生鱼类种多量大，据调查鉴定，有36种河鱼。

垂钓有三种：1.滩潭垂钓。2.高山湿地垂钓。3.池塘垂钓家鱼。

山涧漂流

虾公塘的河段长，水面宽（10米—50米宽）。河道弯曲，急水滩、缓水滩、深潭较多，有利漂流。游客坐上竹筏，穿行狭谷，可览赏两岸奇景。

四、林区观鸟

虾公塘地处谷地，竹木茂盛，花果常有，故百鸟相聚。虾公塘梅花落地观鸟区，是中国仅有的两大观鸟区之一，是南方鸟类科考基地。

越野行车

可骑上山地自行车，越野游览。

丹霞飞瀑

在接待中心的对面山头上，有个瀑布在绿叶虚掩中飞泻而下，终年不竭。这处丹霞飞瀑，远看近观各不同。远看，白瀑配绿树奇花簇簇。近观，瀑声如雷，花香溅飞珠。

山珍餐饮

可供药食两用的山野菜有154种，其中有藻类植物、菌类植物、蕨类植物、种子植物等四大类。从银耳、黑木耳、香菇等菌类植物；紫萁、蕨、凤丫蕨、苦竹笋等直到一些种子植物，均可摆上餐桌。

客家民俗展览

九连山客家区民俗古朴，保留较多原生状态习俗。内容可分五个部分。

（一）客家服饰，原装衣裤、童帽、花鞋、棕履、头帕等等。

（二）生活用具，如炊具、餐具、烟具、雨具、睡具、灯具等等。

（三）生产工具，如锄铲铁扎、柴刀畚萁、柴落竹蒌等等。

（四）加工工具，如砻、碓、磨、风车等等。

（五）文化活动，如祭祀、山歌、谜语、私塾等等。

2019年10月18日，入选“中国森林氧吧”榜单。

2021年2月5日，被中国林学会命名为第五批全国林草科普基地，有效期为2021年～2024年。

2023年8月，江西九连山国家级自然保护区科研人员与龙南市林业局在共同开展国家重点保护野生植物补充调查工作时，发现一罕见植物。经赣南师范大学南岭植物资源保护与利用团队谢宜飞博士解剖观察并查阅资料，最终鉴定为列当科Orobanchaceae假野菰属Christisonia广东假野菰Christisoniakwangtungensis(Hu) G.D.Tang, J.F.Liu & W.B.Yu。

2023年10月，江西赣州龙南市九连山保护区科研人员在对丹霞地貌植物野外调查中，发现一种全新的草本植物，经过确认属于苦苣苔科报春苣苔属的新物种——弧冠报春苣苔。