江西井冈山国家级自然保护区主要保护对象为中亚热带湿润常绿阔叶林生态系统及其生物多样性。区内植被起源古老，有“第三纪型森林”、“天然动植物园”和“亚热带绿色明珠”之称，植被类型多样，生物资源十分丰富。截至2014年，分布有常绿阔叶林、落叶阔叶林等12个植被类型，92个植被群系，维管束植物达3400多种，脊椎动物（不含鱼类）有406种，昆虫3000多种，其中有国家一级保护野生植物南方红豆杉、伯乐树、银杏、资源冷杉4种，国家二级保护野生植物36种，井冈山特有植物24种；有国家一级保护野生动物黄腹角雉、白颈长尾雉、金斑喙凤蝶、豹、云豹、华南虎等6种，国家二级保护野生动物36种，区内还有世界上同纬度保存最完整的中亚热带天然常绿阔叶林，是研究中国乃至全球中亚热带生物资源的重要基地。

截至2014年，保护区有植物280余科800余属3400余种，区内分布有珍稀濒危植物190余种，已列为国家重点保护植物的达40种。其中国家一级重点保护植物4种，既南方红豆杉、伯乐树、银杏与资源冷杉。国家二级重点保护植物36种为野山茶、独花兰、香果树等。

截至2014年，已正式发表的井冈山特有植物20种(含变种)。它们是：井冈山紫果槭、井冈山猕猴桃、井冈山冈风丫蕨、井冈山槠、井冈山毛蕨、井冈山卫矛、井冈山寒竹、井冈山冬青、短柄香冬青、井冈山剑蕨、井冈山绣线梅、井冈山耳蕨、井冈山杜鹃、背绒杜鹃、白花映山红、腺果悬钩子、大节赤竹、井冈山唐竹、井冈山厚皮香、井冈山葡萄。

江西井冈山国家级自然保护区的地带性植被属中亚热带东部湿润南部亚热带常绿阔叶林。植被的垂直分布是：海拔250～1400米为常绿阔叶林，1400～1600米为山地针叶林，1300～1500米为山顶矮林，1600～1800米为山顶灌丛。

截至2014年，江西井冈山国家级自然保护区陆栖脊椎动物有260多种，昆虫3000多种。国家保护动物一级有华南虎、云豹、金钱豹、黄腹角雉、白颈长尾雉；二级有短尾猴、猕猴、水鹿、斑羚、鬣羚、金猫、大灵猫、小灵猫、穿山甲、白鹇、锦鸡、鸳鸯、大鲵等。鸟类中特产井冈山的有灰胸竹鸡、黄腹山雀、绿鹦嘴鹎、画眉等。

管理机构为江西井冈山国家级自然保护区管理局，截至2014年，内设10个科室（所）5个站，分别为：办公室（与党委办公室合署）、资源保护管理科、规划建设科、社区管理科、经营管理科、武装部、计划生育办公室、群团科、野生动植物保护研究所、森林防火指挥中心办公室、大井保护站、行洲保护站、小溪洞保护站、罗浮保护站、湘洲保护站，均为正科级单位。

旅游景点

江西井冈山国家级自然保护区地处赣江中上游，集雨面积大，对涵养水源、防止水土流失、维护自然生态平衡等发挥了重要作用。不仅对保障赣江中下游城市工农业生产和人民生活起到重要作用，同时对赣江中下游水利枢纽的正常运作，以及对赣江流域特别是鄱阳湖及至长江中下游的生态平衡和水土保持也起到积极作用。

该保护区植物区系起源古老。古生物研究资料表明，早在中生代三迭纪末期，江西大地为裸子植物所统治，萍乡煤矿就发现有古代苏铁的化石。到白垩纪时被子植物发展起来。从新构造运动以后的新生代古新世，江西古气候由于热变为温暖湿润。一些适于干热的古老被子植物逐渐衰败，被喜湿热的现代被子植物所更新，虽然经历了多次冰期和间冰期的干扰，但没有改变水热分布的总趋势，所以这些湿热植物的后裔一直繁衍至今，对科学研究有重要意义。

保护和管理好井冈山国家级自然保护区，对维护生态安全和实施可持续发展战略具有十分重要的意义。保护区管理局充分认识到做好保护区自然资源和生物多样性保护工作的重要意义，始终把自然资源保护和科学合理利用工作放在一切工作的首位，坚持“依法保护、科学管理、合理利用”方针，加强领导、积极采取有效措施，确保了保护区资源、环境的安全和井冈山经济可持续发展。

2021年2月5日，被中国林学会命名为第五批全国林草科普基地，有效期为2021年～2024年。