流溪河季节流量变化大，易形成涝灾。

民国21年（1932），“七月二十九日至八月四日，连日淫雨为灾，自高塘以下至石井潭村，水势浩大，田亩被淹没，成为一片汪洋。流溪河沿岸之钟落潭、竹料、鸦湖、蚌湖等村，亦因山洪与西潦相遇，堤围崩溃，农田淹没，屋宇倒塌甚多。”

1951年6月16日，流溪河水暴涨，龙洞坑围水闸被毁，决堤10多米。

1957年5月上、中旬区内连降暴雨，5月20日降雨达208.6毫米，当日14～15时35分，降雨153.6毫米，时雨量达97毫米，流溪河水暴涨，堤围多处决口，岭南围内受涝面积1.97万亩，磨刀坑一带山洪暴发，鬼叫窿山塘被冲毁，五边、望岗一带田野，西瓜到处漂流。全区塌房53间，死8人，伤9人。

1981年6月3日，白云区内东北部连降暴雨，山洪暴发，流溪河水位上涨，凤尾坑等冲决堤围4处，2个山塘决口，1个山塘被冲坏排水涵管。流溪河沿岸堤围积水成灾，受浸农田3万多亩。

1983年6月16日，白云区郊区、从化连降暴雨，流溪河洪水暴涨，从化境内流溪河沿岸堤围崩决，流溪河灌溉工程左、右干渠被冲崩，决口11处，冲毁渠道建筑物6座，整个工程停水20多天，灌区生产受到严重影响。

流溪河流域支流众多，在从化区内有吕田河、竹坑河、石坝河、牛栏河、楠木河（又叫玉溪水）、联溪水、汾田水（又叫黄龙带水）、牛路水、达溪水、北斗水、鸭洞河、石岭水、龙潭河（又叫黎塘水）、棋杆水、小海河（又叫曲江水）、概洞水、凤凰水、罗洞水、锦洞水、三百洞水、隔岭坑（又叫井岗水、银林水）、湖田水、格塘水、沙溪水与鹿胫坑等。其中集雨面积在100平方公里以上的主要支流有小海河、吕田河、楠木河、龙潭河、牛栏河和汾田水等6条。

小海河，是流溪河流域中集雨面积最大的一条支流，河长37.5公里，集雨面积260平方公里。明、清时期该河叫曲江水。该河有3条支流，一源于大岭山林场的白芒潭，一源于溉洞，一源于灌村中心山。流经市内的桃园、灌村、江埔等3个镇的大部分，流域内有耕地面积6万余亩，人口约6万人。

吕田河，河长24.8公里，集雨面积228.96平方公里。其源头一段称桂峰水，起源于吕田东面与龙门县交界的桂峰山西麓。该河流经吕田的桂峰、联丰、官联、吕新、吕中、水埔、狮象等村。其中又有两条主要支流石坝河和竹坑水汇入。石坝河源于吕田小杉的石牙顶西麓，流经官洞、石坝村，于邓村附近与桂峰水会合，成为吕田河的主流，再往西流向吕田圩、水埔村方向。竹坑水源于吕田与东明之间的白米石南麓，流经吕田的竹坑口，在上黄径附近汇入吕田河主流。吕田河主流在上黄径西南约2.5公里处的水口附近与流溪河的另一支流牛栏河相汇合后流入流溪河水库。

楠木江，又名玉溪水，长38.7公里，集雨面积182平方公里，河床平均坡降为1/60。楠木江发源于吕田、东明与新丰县交界处北面的七星顶南麓，流经新丰的石桥等地，进入辖区内后经东明的上大步、下和洞、北溪村注入流溪河水库尾。楠木江是流溪河上游的一条较长的支流，其中又有几条小溪分别从东明与佛冈县交界的通天蜡烛、黄金脑东麓，东明的樟木头西麓及君子嶂北麓等地流下汇入。

龙潭河，河长29.7公里，集雨面积157平方公里，河床平均坡降为1/80。龙潭河源于城郊北部与佛冈县交界处的黄猄滩（地名）。其干流自北向南经城郊的龙潭口、康村、大夫田等地，在流过风云岭脚下，经黎塘汇入流溪河。该河有一条支流从棋杆横岭村附近的山丘流下，经西塘、棋杆圩、步尾等地，在城郊的石合与三将军之间加入龙潭河主流。

牛栏河，又名安山河，长20.3公里，集雨面积118.4平方公里。该河发源于良口锦村的牛角窿，在南向北流经溪头、河背村，到吕田的古村后折向东，经火烧牛栏（地名）后再向北，在水口同吕田河汇合注入流溪河水库尾。牛栏河有一条主流源于吕田小杉横坑口，自东向西流经九曲水、马鞍山脚，在镇安附近加入干流。

牛栏河流域有吕田的小杉、草埔、安山（镇安）、旱田和良口的联溪（溪头）、三村等地，有耕地7000多亩，人口约8000人。

汾田水，又名黄龙带水，河长22.7公里，中间建有总库容为9458万立方米的黄龙带水库，流域集雨面积100.5平方公里，河床平均坡降1/46。该河发源于东明与佛冈县交界的黄金脑（山名），源头分两支，均自北向南流。其一源于山麓西北，沿市边界走向，在佛冈县奔流4公里后入从化，直接流入黄龙带；另一源于山麓东南，流经东明的长芨、梅树等地，两条溪流在黄龙带水库尾汇合成汾田水。该河出黄龙带水库后，流过黄龙山和黄牛山之间的峡谷，与从流溪河水库放出的流溪河上游水流汇合，流向流溪河中下游地区。汾田水流域内有东明区与黄龙带水库管理处，耕地约1.3万亩。人口约9000人。

流溪河在白云区的主要支流有:

鹿颈坑，发源于从化新庄，下游经钟落潭镇上水庄与从化太平场之间入流溪河。全长11公里，集水面积65.98平方公里。在区内河段长2.5公里，集水面积5.25平方公里。

凤尾坑，古称良坑，发源于帽峰山东麓，经沙田、莲塘、枫下、凤尾等村，至黎家塘入流溪河，全长17公里，集水面积71.25平方公里。

良田坑，古称华坑，发源于帽峰山北麓。原经良田镇华坑、陈洞、良田等村，至竹料，1958年建竹料围，改道经东凤至中和与头陂坑汇合经龙塘入流溪河。干流长16公里，集水面积59.58平方公里。头陂坑，古称清水坑，发源于帽峰山西北，流经铜锣湾、头陂、九曲迳，至中和与良田坑汇合。干流长15.5公里，上游建有铜锣湾水库，库容280万立方米，控制集水面积6.5平方公里。

兔岗坑，发源于花都市张公岭，从人和镇汉塘村流入白云区，流经兔岗、高增入流溪河。干流长19.5公里，集水面积51平方公里。流经白云境内干流长8.95公里。

沙坑，发源于帽峰山西麓，经白山、禾岭与大源洞坑汇合，流经石湖、北村、柏塘等村至蚌湖镇新坦庄入流溪河。干流长16公里，集水面积51平方公里。上游建有和龙、梅窿、大源水库，库容共1938.4万立方米，控制集水面积29.1平方公里。

磨刀坑，发源于洞旗峰，流经新市镇望岗、科甲等村，汇入南园水，经清湖至石马入流溪河。干流长16.75公里，集水面积48平方公里。上游建有磨刀坑、红路水库，库容共807万立方米，控制集水面积11.28平方公里。

白坭河，又称巴江河，发源于花都市天堂顶，于洲咀口汇合新街河流入白云区。经神山、江高两镇至石井镇鸦岗附近三江口汇合流溪河，流入珠江西航道。干流全长53公里（区境河段长约10公里），集水面积788平方公里。主要支流有芦苞涌、西南涌（在三水市境内）、国泰河（在花都市境内），上游与北江相通。白坭河是北江洪水下泄的主要通道，每年汛期，对神山、江高、石井、新市等镇有很大威胁。

流溪河良口以上上游河道，原先两岸石壁陡峭，河道深窄。1958年，广东省水利电力厅在良口小车村的峡谷中，兴建一座总库容为3.86亿立方米的流溪河水库，控制其上游集雨面积达539平方公里。此后，这一带变成“高峡出平湖”的景观。

流溪河的中下游因有众多支流汇入，水量渐大，河面宽度达200-300米，1958年前可通航，从良口至太平场的航程约66公里。1958年后，流溪河水库、温泉人工湖发电站及神岗大坳引水灌溉拦河坝等水利电力工程相继建成，流溪河在辖区内的航运亦随之中止。

流溪河流域内，由于森林曾数度遭乱砍滥伐，加上不合理的开荒，造成大面积水土流失，也使流溪河河床遭受淤积。1968-1975年8年间，街口大桥附近河段的河床淤高1.1米。从1980年代开始，流溪河大量河砂被采掘用于建设，河床淤高大大降低，部分河段河床有下切现象。

建国以来，流溪河干、支流均已进行开发利用，上游从化、花都境内，建有中、小型水库多个，拦河坝多座，用以调节流量。白云区建成人和拦河坝，引水流量2立方米每秒，设计灌溉面积2万亩。并在各支流上建成新陂、白汾、南塘、沙田、铜锣湾、和龙、梅窿、大源、红路、磨刀坑等水库，库容共4303万立方米，控制集雨面积59.8平方公里。90年代，对流溪河上游河段进行了综合整治。

流溪河在街口附近一段河道的走向变迁十分明显。据清雍正八年《从化县志·山川志》记载，流溪河流经麻村、塘下之后，过东风村的殷家庄口、田边村口到青苔坑（即今街口街的北街口一带），转向今河滨公园、石角潭（即今河西河堤广场金瓯址），折入鱼梁尾、陈屋（即今物资局址）、流入古楼潭（即今市人民政府招待所址）、流下门口江、再流经洪山围门口而至蓝田古庙，在蓝田水闸口外有龙潭河汇入，然后流向东南方。上述许多地方已为街口街的建筑群所代替，流溪河则从街口街的东侧穿过。

2023年10月13日，全国美丽河湖优秀案例第二批名单已通过生态环境部审核并进行公示。其中包括广州市流溪河。

2024年6月24日，流溪河荣获广州市美丽河湖优秀案例（第一批）。