1993年12月至1995年07月，在解放军第三0四医院创伤外科研究室工作。

1995年08月至1995年09月，在英国牛津大学创伤修复研究所工作。

1995年09月至1998年01月，在解放军第三0四医院创伤外科研究室工作。

1995年，获得国家杰出青年科学基金资助。

1998年01月至2001年01月，担任解放军第三0四医院创伤外科研究室主任。

2001年02月至2005年02月，担任解放军第三0四医院全军创伤修复重点实验室主任、教授。

2005年02月，担任解放军总医院第一附属医院全军修复重点实验室主任、教授。

2009年，当选为中国工程院院士。

2011年，成为国家973“创伤和组织修复与再生项目”首席科学家和全军“十二五”战创伤重大项目首席科学家。

2012年，被中共中央宣传部作为重大典型在全国宣传；同年，带领的 “创伤和组织修复与再生”创新团队获得“国家自然科学基金创新研究群体”资助。

2022年1月9日，联勤保障部队隆重举行晋升（授予）专业技术少将军衔仪式，根据中央军委主席习近平签署的命令，付小兵晋升（授予）专业技术少将军衔。

2023年10月11日，获得2023年度吴阶平医学奖。

付小兵长期从事战（创、烧）伤基础研究与临床转化应用工作，主攻方向为战（创、烧）伤修复与组织再生，工作性质为密切结合临床的转化医学。

1998年，付小兵在医学杂志《Lancet》首先报告了成纤维细胞生长因子对烧伤创面的多中心治疗结果，推动了中国基因工程生长因子类国家一类新药的研发与临床应用。

2001年，付小兵在医学杂志《Lancet》首先报告了表皮细胞通过去分化途径转变为表皮干细胞的重要生物学现象，为组织修复和再生提供了原创性的理论根据。

2007年，付小兵所带领的团队在国际上首先利用自体干细胞再生汗腺获得成功，为解决严重创烧伤患者后期的出汗难题提供了基础。

2008年，付小兵发现了中国人体表慢性难愈合创面流行病学变化的新特征，推动了中国慢性难愈合创面防控新体系的建立并取得一定的效果。

付小兵发起组建了中华医学会创伤学分会组织修复学组，参与主持召开了“再生医学”香山科学会议和工程院“炎症与修复”工程科技论坛等，他还参与全军和中国工程院“十二五”再生医学方面发展规划的制订工作。

根据2020年10月中国工程院网站显示，付小兵主编出版《中华创伤医学》《再生医学：基础与临床》和英文版《Advanced Trauma and Surgery》等学术专著23部，参编30余部，在Lancet等中国国内外杂志发表学术论文600余篇。1991年主编出版了中国国内第一部系统论述《生长因子与创伤修复》学术专著。

根据2020年10月中国工程院网站显示，付小兵以第一完成人获国家科技进步奖一等奖1项，二等奖3项，以第二完成人或国家科技进步奖创新团队奖。

截至2018年4月，付小兵带领的创新研究群体中，先后培养了2位国家杰出青年基金获得者，7人次获得总后科技金星、银星以及新星称号。

付小兵主编出版了研究生教材《创伤、烧伤与再生医学》，全国高等学校教材《干细胞与再生医学》。

付小兵整合了解放军总医院基础医学研究所和304临床部的战创伤研究力量，聚集科学目标，建成了中国第一个创新和谐的战创伤与组织修复和再生创新研究群体。他带领的解放总医院304临床部创伤外科研究室在2010年被评为北京市“皮肤损伤修复与组织再生重点实验室”，在2011至2012全军重点实验室考核评估中继续保持优秀，并晋升为全军后勤重点实验室。2012年付小兵牵头申报的解放军总医院基础医学博士后流动站获得国家批准，使解放军总医院获得国家基础医学博士后流动站。

2023年，付小兵荣获“全军科技工作先进个人”荣誉。

付小兵是中国战创伤医学和组织修复与再生医学领域公认的新一代领军人物和优秀的学科与学术带头人，是军队医疗卫生战线科技创新的“时代先锋”。长期以来，付小兵从“牢记强军使命、勇攀科技高峰、建立创新群体、成果服务大众”等方面实现自己的人生价值，对从整体上提高中国人民解放军战（创、烧）救治能力和水平做出了突出贡献，为促进军队现代化卫勤建设、保障战争打赢提供了重要的智力支持。（中国军视网评）

付小兵是中国现代创伤和组织修复与再生医学研究的代表人物之一，他编著出版了中国国内第一部有关生长因子与创伤修复的专著，对中国之后大规模地开展这项研究起到了先导、推动和促进作用，他推动中国再生医学从基础研究转化为临床应用的迅速发展。（解放军总医院第一附属医院政治部电视宣传中心评）