仙宁铁路贯穿于南京市雨花台、江宁、秦淮（2013年3月秦淮区、白下区两区所辖区域设立新的秦淮区）、玄武、栖霞五个行政区，是连接南京南站宁安场与沪宁城际铁路上海方向的客车通路。线路自宁安场东端引出后与宁蓉至高速上行联络线并行一段后跨秦淮河，再上跨京沪高速铁路、宁杭高速公路、运粮河、规划预留沧波门货场走行线，并行既有宁芜线南侧向东，穿宁镇公路、仙尧公路后疏解接入沪宁城际铁路仙林站。