球队建于1898年3月14日，取名相对照于已经解散的俱乐部巴塞尔老伙计队。俱乐部的首场比赛是在次年的6月17日对阵FC Viktoria。球队在1909年,1910年和1911年连续三年夺得瑞士联赛冠军。

在1925年俱乐部搬入新落成的范可多夫体育场（Wankdorf Stadium），并且将球队的队名从“足球俱乐部”（FC）改为 “伯尔尼体育俱乐部”（BSC），因为俱乐部不止拥有足球队，还拥有地板滚球、手球和曲棍球等项目。

俱乐部的黄金期出现在1950年代，球队在1953年和1958年夺取了瑞士杯的冠军头衔，并且从1957年起连续4年取得瑞士联赛冠军。

在2001年至2005年赛季中年轻人将主场放在了Neufeldstadion，作为1954年世界杯决赛和1961年欧洲足球锦标赛的场地，范可多夫体育场拆除重建。在2005年夏天竣工后球队再次迁回新的Stade de Suisse, Wankdorf。