1981年，何红建考入清华大学工程物理系近代物理专业。

1986年，获得清华大学物理系学士学位。

1988年，获得清华大学硕士学位。

1992年，获得清华大学博士学位，后在德国电子同步加速器中心（DESY）国家实验室、密歇根州立大学从事研究工作。

2000年—2005年，在得克萨斯大学奥斯汀分校做研究学者。

2005年—2017年，任清华大学教授。

2006年，获得“国家杰出青年科学基金”资助。

2017年，获聘为上海交通大学物理天文学院、李政道研究所特聘教授。

2023年，当选为美国物理学会会士。

何红建研究粒子物理、量子引力和宇宙学及其交叉方向的基础性前沿问题。对质量起源与散射振幅进行了开拓性研究，包括标准模型希格斯机制、卡鲁察-克莱因几何希格斯机制、和陈-西蒙斯拓扑质量产生机制；提出和证明引力等价定理和拓扑等价定理，表述和证明标准模型以及有效场论中电弱等价定理，在散射振幅层次定量表述质量产生机制。对有质量规范与引力散射振幅、有质量规范-引力对偶性与双重复制在量子场论和弦论中的实现作出研究。提出研究希格斯的引力作用及其检验，解决希格斯暴胀幺正性问题的长期疑难，提出希格斯暴胀机制的多种实现，与宇宙学观测一致。研究暗能量与引力透镜、暗物质与宇宙线、哈勃疑难等前沿课题。对夸克/轻子/中微子质量产生的能量标度、新的中性和带电希格斯粒子产生与探测、有效场论与形状因子、对撞机与新物理检验、物质与暗物质起源、暗物质和暗能量的机理与检验、中微子味对称性与破缺机制及其预言、中微子振荡与CP破坏的几何表述等多个基础性前沿课题进行系统研究。与国际实验合作组合作，其多种理论预言与分析方法被实验合作组采纳和引用。