何氏历代业医，晚年寓居上海南市。幼承家学，精于医术，治病有奇效，名振于时。有医德，往返于重固、罗店、颛桥等地。又备药罐、炭炉于寿山堂药店，方便患者。部分医案见于陆晋笙所辑《重固三何医案》中。有《何鸿舫编年药方墨迹》、《何鸿舫医案》二书行世。

幼年受严格的家庭教育，酷爱诗文，亦工词曲。十岁丧父后，决心继承家学，遂刻苦钻研歧黄之术，成为名医，“病者求治，户限为穿”。道光二十九年(1849年)遇水灾，迁居松江颛桥，晚年在上海城内设诊所。先后培育门生30多人，行医于沪杭一带。光绪十五年病逝于上海，终年68岁。何长治善书法，学颜真卿，字体秀逸苍劲。间画墨梅，世不易得。处方墨迹，为艺术珍品，病家、医家、书法爱好者珍若拱壁，日本人亦多方搜求。遗著有《续医人史传》、《通波惰农诗稿》、《还如阁诗存》等。