2003年，在历史商战剧《大染坊》中饰演印染业奇才陈寿亭，凭借在片中的精彩演出，获得2004年第22届中国电视金鹰奖暨第5届中国金鹰电视艺术节最佳表演艺术奖男演员奖、最受观众喜爱的电视剧男演员奖，第24届中国电视剧飞天奖优秀男演员奖三项大奖；同年，在由央视影视部、八一电影制片厂、公安部政治部和修正药业集团联合摄制，表现新中国基层公安派出所成长历程的电视剧《无愧苍生》中饰演年轻的东北民主联军战士任福祥；同年，在电视剧《白银谷》中饰演康三爷；同年，出演电视剧《天高地厚》；同年，出演电视剧《末代皇妃》。

2004年，主演反映中国工程院院士成长历程的电视剧《追日》；同年，在电视剧《中华之剑》中首次饰演黑帮老大；同年，在王文杰导演的古装电视剧《开创盛世》中出演唐朝有名的谏议大臣魏征；同年，在《浪子燕青》饰演宋徽宗；同年，出演电视剧《铁色高原》，就在拍摄《铁色高原》时，叶大鹰导演临时让侯勇接替姜文在电视剧《陈赓大将》中出演陈赓。

2005年，主演军事题材剧《沙场点兵》；同年，与斯琴高娃、巍子共同出演电视剧《沧海英雄》；同年，在高希希执导的电视剧《真情年代》中与殷桃、丁志诚共同演绎上山下乡年代的纠葛爱情；同年，友情出演南京军区前线文工团作品《上将许世友》中陈赓一角；同年，在都是情感剧《不能没有你》中扮演反面人物沈阳；同年，在舒淇主演的首部内地古装剧《风尘三侠之红拂女》中饰演唐高祖李渊；9月，受邀主持第五届徐福节。

2006年，主演根据缉毒英雄吴光林为原型拍摄的影片《缉毒警》；同年，出演电影《车祸疑云》。

2007年，在电视剧《井冈山》中扮演秋收起义暴动部队总指挥卢德铭；同年，与田海蓉主演间谍剧《狂花凋落》；同年，在电视剧《DA师》的续集《狼烟》中出演配角桂平原；同年，在宋业明执导的电影《八月一日》中饰演开国元勋贺龙，凭借影片获得第15届北京大学生电影节最受大学生喜爱的男演员奖以及第1届北京影视春燕奖电影最佳男配角奖；同年，出演主旋律电影《公仆》；同年，与夏雨共同出演献礼十七大影片《江北好人》。

2008年，在吴宇森执导电影《赤壁》中饰演鲁肃；同年，在军旅剧《高地》中饰演兰泽光；同年，在被誉为中国版“加里森敢死队”的谍战大戏《特战先锋》中饰演共产党员黄天明；同年，在《七十七封阵亡通知书》中饰演生活最底层的司机一角。

2009年，在电视剧《大秦帝国》中饰演战国初期最杰出的君主秦孝公，再次与导演郑方南合作出演电视剧《弹孔》中的一名红军首长；同年，主演悬疑剧《夜来香》；同年，在康洪雷导演的电视剧《奠基者》中饰演独臂将军余秋里；同年，主演纪念辛亥革命百年献礼作品《陕北汉子》；同年，与应采儿主演谍战剧《冰是睡着的水》；同年，在电影《建国大业》中客串陈赓；同年，与李幼斌主演电影《惊天动地》，在片中饰演某集团军摩步旅旅长唐新生。

2010年，主演家庭情感剧《幸福攻略》，在剧中做起了居家男人；同年，在抗战剧《旗袍旗袍》中饰演上海滩“暗杀王”王九洲；同年，在家庭情感剧《一家不说两家话》客串一个性格软弱的小人物李国安；同年，在军事励志剧《我是特种兵》扮演特种兵大队长；同年，在电影《建党伟业》中饰演唐绍仪。

2011年，主演阚卫平执导的海峡亲情剧《兄弟海》；同年，友情出演电视剧《大营救》；同年，与王雅捷领衔主演抗战剧《冬日惊雷》，在剧中饰演日军特务行动队的副队长钱广来；同年，在军旅偶像剧《我是特种兵之利刃出鞘》中出演狼牙特战旅大队长何志军；同年，主演根据2010感动中国人物郭明义为原型改编的献礼建党90周年的电影《郭明义》；同年，在黑色喜剧电影《一路惊心》中饰演公安局长；同年，在刘之冰、郭晓冬主演的以中共监察委员会成立史实为背景的电影《忠诚与背叛》中演酒馆老板；同年，在少儿贺岁电影《小小飞虎队》中饰演老吴。

2012年，加盟时尚青春的军旅剧《麻辣女兵》；同年，在电视剧《与狼共舞》中跑龙套演何掌柜；同年，客串出演电影《血滴子》《平壤之约》《温故一九四二》。

2013年，与沈傲君、许亚军主演温暖系剧《温暖的日子》，在剧中饰演憨厚、老实的铁匠三猛子；同年，在特种兵系列剧《特种兵之火凤凰》中饰演狼牙特战基地司令；同年，出演纪念开国将领周希汉诞辰一百周年的影片《战将周希汉》，在片中扮演国家和中国人民解放军的优秀领导者陈赓；同年，在轻喜剧励志电影《80后的独立宣言》中与何赛飞扮演一对“苦尽甘来”的夫妻。

2014年8月，与歌唱家王莉牵手参加CCTV-15音乐频道中国情歌大汇，演唱歌曲《因为爱情》；10月30日 ，主演的史诗电视剧《大秦帝国之裂变》在央视电视剧频道播出，在剧中饰演秦孝公。

2015年，领衔主演的抗日历史剧《追我魂魄·英雄吉鸿昌》播出，在剧中饰演革命烈士吉鸿昌；5月，出演抗战史诗剧《宜昌保卫战》，在剧中饰演国民党上将衔陆军中将。

2016年2月7日，在央视春晚联欢晚会上演唱歌曲《将军与士兵》；5月24日，在都市情感剧《下辈子还做我老爸》中饰演西北汉子沙陀；6月30日，庆祝中国共产党成立95周年电视文艺特别节目《伟大的旗帜》在央视一套、三套黄金档播出，侯勇与周征波主演情景剧《长征》；同年，主演革命抗战剧《铁血将军》，在剧中饰演军事战略指挥家范筑先。

2016年5月，参演历史革命电影《大会师》，在片中饰演中国人民解放军的创始人和主要领导者之一贺龙。

2017年3月，参演检察反腐剧《人民的名义》，在剧中饰演国家某部委某处长赵德汉。

2018年3月16日，与陈妍希、何润东合作主演的人物传记剧《邓丽君之我只在乎你》正式开机。

2019年8月1日，主演消防题材电影《烈火英雄》；9月12日，参演的电影《一切如你》上映。

2020年5月1日，参加中华全国总工会和中央广播电视总台共同举办的《中国梦·劳动美——致敬劳动者五·一特别节目》，与马少骅、刘佩琦、吴京安、倪大红、刘劲共同演绎了一首诗朗诵《向胜利进军》；6月，参演电影《永失我心》；9月4日，与于震、梅婷主演军旅大剧《蓝军出击》在江苏卫视独播，在剧中饰演沈军；9月30日，参加央视国庆晚会《“中国梦·祖国颂”——2020国庆特别节目》，与吴刚、吴京安合唱歌曲《国土》；12月2日，特别出演的动作罪案剧《功夫战警》播出。

2021年，参演程前执导的年代剧《铸匠》；同年，参演建党百年献礼剧《理想照耀中国》；同年，参演年代传奇剧《一剪芳华》。

2022年2月10日，特别出演的反黑题材电影《操场》正式开机；8月，参演电视剧《我们这十年·心之所向》杀青；8月19日，与杨烁、焦俊艳等主演当代工业剧《麓山之歌》播出，在剧中饰演方锐舟；9月9日，将参加湖南卫视 《匠心闪耀》。

2023年5月21日，参演的电视剧《一代匠师》播出。9月15日，参演的电影《毒蜂》播出。

2024年1月12日，参演电影《深海之光》正式开机；3月4日，参演的军旅剧《我站的地方是中国》开机；4月27日，参加第四届新时代国际电视节斑彩螺奖红毯及颁奖典礼，担任新时代最佳导演奖项和新时代最佳男主角奖项的颁奖嘉宾；6月6日，参演的电影《丛林追击》全网首播。2024年6月6日，参演电视剧《但愿人长久》于19:30在江苏卫视播出，在剧中饰演邓枢。6月8日，参演的电影《扫黑·决不放弃》上映。6月11日，主演的电视剧《海天雄鹰》播出。2024年8月1日，参与“八一”特别节目《向着胜利》。2024年，主演电视剧《浴血荣光》。

1992年，侯勇与南京艺术学院表演系的同班同学沈蓉结婚，后来离婚。

2011年，和演员潘雨辰在辽宁东港举行婚礼，之后再次离婚。

2017年10月10日，侯勇与圈外女友王瑞结婚。

2018年1月13日，侯勇在微博上分享了自己中国人民解放军文职干部转业证书的照片。

侯勇是连云港妇联的代言人。

2020年1月5日，侯勇当选为第七届江苏省电影家协会主席。

2021年12月20日，华鼎奖集团在澳门公布了第32届华鼎奖·上汽大众新威然之夜中国百强电视剧满意度调查发布盛典的专家评委会阵容，侯勇担任第32届华鼎奖评委；12月29日，当选中国电视艺术家协会演员工作委员会副会长。

2022年3月，参演歌曲《灯火》抗疫特别版，为吉林加油 ；7月，入选第二届澳涞坞国际电视节金萱奖评委会名单。

侯勇在电影《冲出亚马逊》中崭露头角，在电视剧《大染坊》中饰演传奇商人陈寿亭而为广大观众所熟知，之后凭着《DA师》《无愧苍生》《陈赓大将》《我是特种兵》中一个个经典角色的塑造而成为硬汉专业户。他曾经一年365天拍摄七部分别五十多集的电视剧，夜以继日奔波在片场剧组中，各种艰辛可想而知。（BTV文艺、电影杂志评）

成名后的侯勇仍然保持港城人朴素的本色，兢兢业业地对待每一场戏。（中共江苏省委新闻网评）