更新时间：2024-08-15 18:48
花音恢复了人类的身姿后，迎来了第一次的生日——突然，事件发生了。假面骑士Dark Ghost率领3人的假面骑士Dark Necrom出现在小尊他们的面前。在战斗中，小尊、诚、亚伦，然后明里、御成、花音，被吸进七色的光芒的方向里去。他们到达的地方是历史上的伟人们的灵魂被实体化后，所生活在不可思议的村落。但是，假面骑士Dark Ghost是用这个村子的英雄们的灵魂，来收集100个眼魂完成“究极的眼魂”。如果“究极的眼魂”完成的话，所有世界的人都会变成鬼魂。假面骑士Dark Ghost的真实身份居然是亚伦已经去世的大哥·阿尔戈斯。另一方面，诚和长的间失踪的父亲·深海大悟再次相会了。亚伦对阿尔戈斯的计划提出异议。然后，阿尔戈斯俘虏了花音，来要挟诚的帮助自己，大悟不可理解的行动，使诚与之发生激烈的冲突，不久诚=假面骑士Specter和大悟=假面骑士Zero Specter父子对决！
前往阻止“究极的眼魂”的完成。跨越了无数考验的小尊，现在面临着最终的选择。阻止全人类变成鬼魂的方法只有一个。
“再见，我！”
命运的瞬间——小尊，明里在想什么呢!?
眼魂岛
模仿眼魂的异世界。有英雄之村等，也是本作的舞台。
英雄之村
曾经有过成就的伟人和英雄们所居住的村子。宫本武藏和卑弥呼等超越时代和国家的各种各样人物都居住在这里。但是，小尊他们所持有的眼魂的英雄们没有眼魂时的记忆。
暗黑Ghost眼魂
阿尔戈斯从仙人（伊迪斯）那里收到了幽灵眼魂。除了图案和颜色以外，与Ghost的我魂基本相同。在TV系列的最后阶段，仙人也使用过同样的东西。
Zero Specter眼魂
深海大悟所持有的幽灵眼魂。造型与“Specter”幽灵眼魂基本相似，颜色以紫为主，头部上有3个角，脸上的图案也相对分明。
拿破仑眼魂
拿破仑·波拿巴之魂寄宿的幽灵眼魂。在剧场版公开纪念1分钟故事的第1话开头，Dark Ghost袭击了他，并变成了眼魂。
一休眼魂
一休宗纯之魂寄宿的幽灵眼魂。最初是在『电视君超战斗DVD』登场，在本作中，住在英雄之村里的他已变成了眼魂的形状，在剧场版公开纪念1分钟故事的第1话里，已经是阿尔戈斯所持有。
毕达哥拉斯眼魂
毕达哥拉斯之魂寄宿的幽灵眼魂。最初是在『电视君超战斗DVD』登场，在本作品中，住在英雄之村里的他已变成眼魂的形状，在剧场版公开纪念1分钟故事的第1话里，已经是阿尔戈斯所持有。
达尔文眼魂
查尔斯·达尔文之魂寄宿的幽灵眼魂。寄宿着进化之力，对于究极的眼魂的产生来说是不可缺少的，所以遭到阿尔戈斯的追杀。因此被大悟藏匿起来。