更新时间：2023-12-23 17:49
泥河湾短剑虎（Megantereon nihowanensis）
爪蹄兽（Nestoritherium sp.）
龙川始柱角鹿（Eostyloceros lungchunensis）
细麂（Metacervulus attennatus）
湖麂（Muntiacus lacustris）
最后柱角鹿（Cervoceros ultimus）
纤细原始麅（Procapreolus stenosis）
矮小麂（Muntiacus nanus）
更新世早期的种类，元谋狼（Canis yuanmoensis）、鸡骨山狐（Vulpes cf.chikushanensis）、化石小灵猫（Viverxicula malaccensis fossils）、桑氏鬣狗（Hyaena licenti）、昭通剑齿象（Stegodon zhaotongense）、元谋剑齿象（Stegodon yuanmoense）、类象剑齿象（Stegodon elephantoides）、云南马（Equus yunnanensis）、中国犀（Rhinoceros sinensis）、复齿短耳兔（Ochotonoides complicidens）、山西轴鹿（Axis shansius）、粗面轴鹿（Axis cf.rugosus）、斯氏鹿（Rusa stehlimi）。
元谋动物群中除个别现生种外，其余均为绝灭种。元谋动物群同华南各地的大熊猫—剑齿象动物群有一定的联系，如中国犀、化石小灵猫在两个动物群中均存在，但大熊猫—剑齿象动物群中的一些典型种类，如大熊猫、中国熊、猩猩及猕猴等，在元谋动物群中却没有发现。元谋动物群与华北三趾马动物群及泥河湾动物群有较密切的联系。如桑氏鬣狗、泥河湾剑齿虎、爪兽、复齿短耳兔、山西轴鹿、粗面轴鹿等同样存在于泥河湾动物群中。云南东北部昭通地区发现的昭通动物群（Zhaotong fauna），时代为更新世，相当于元谋动物群。