全光网络与现代通信网教育部重点实验室主体的前身是北京交通大学光波技术研究所，成立于1987年6月5日。

1995年2月7日经铁道部批准成立光纤技术及铁路应用工程研究中心，正式对外开放。

2002年1月9日经教育部正式批准成立“全光网络与现代信息网”教育部重点实验室。

实验室面向国民经济发展重大战略需求，面向国际科学前沿，面向国防，面向市场，在全光网络与现代通信网领域，围绕着新型特种光纤、新型光纤器件和光电子器件、新型光路交换系统、基于IP网络关键技术研究及GSM-R铁路移动通信系统五个主要研究方向建立了五大创新实验平台。在简水生院士的领导下，开展了大量原创性的工作。

2007年《教育部关于公布2006年度信息科学领域教育部重点实验室评估结果的通知》（教技函[2006]82号），全光网络与现代通讯网教育部重点实验室被评估为“优秀”。