第四检察部

负责办理向市人民检察院申请监督和提请抗诉的民事案件的审查、抗诉。承办对市中级人民法院民事诉讼活动的法律监督，对审判监督程序以外的其他民事审判程序中审判人员的违法行为提出检察建议，对民事执行活动实行法律监督。开展民事支持起诉工作。办理市人民检察院管辖的民事申诉案件。

第五检察部

负责办理向市人民检察院申请监督和提请抗诉的行政案件的审查、抗诉。承办对市中级人民法院行政诉讼活动的法律监督，对审判监督程序以外的其他行政审判程序中审判人员的违法行为提出检察建议，对行政执行活动实行法律监督。办理市人民检察院管辖的行政申诉案件。

第六检察部

负责办理法律规定由市人民检察院办理的破坏生态环境和资源保护、食品药品安全领域侵害众多消费者合法权益等损害社会公共利益的民事公益诉讼案件，生态环境和资源保护、食品药品安全、国有财产保护、国有土地使用权出让等领域的行政公益诉讼案件，侵害英雄烈士姓名、肖像、名誉、荣誉的公益诉讼案件。负责对市中级人民法院开庭审理的公益诉讼案件，派员出席法庭，依照有关规定提出检察建议。办理市人民检察院管辖的公益诉讼申诉案件。

第七检察部

负责对法律规定由市人民检察院办理的未成年人犯罪和侵害未成年人犯罪案件的审查逮捕、审查起诉、出庭支持公诉、抗诉，开展相关立案监督、侦查监督、审判监督以及相关案件的补充侦查，开展未成年人司法保护和预防未成年人犯罪工作。

第八检察部

负责受理向市人民检察院的控告和申诉。承办市人民检察院管辖的国家赔偿案件和国家司法救助案件。

法律政策研究室

指导并组织开展全市检察理论研究工作，负责司法体制改革综合协调相关工作，承担市人民检察院检察委员会日常工作。负责市人民检察院发出检察建议的合法性审查工作。

案件管理办公室

负责案件的统一受理流转、办案流程监控、涉案财物监管监控、法律文书监管、案件信息公开。统一组织办案质量评查、业务考评和业务统计分析研判。组织指导人民监督员工作。指导全市检察机关统一业务应用系统的应用。

检察技术信息处

负责全市检察机关网络信息化建设和辅助司法办案的指导和组织工作。负责检察技术的指导，参与管辖案件的现场勘验，对搜取的痕迹、物证进行检验鉴定。承担信息安全工作。

检务督察处 （巡察工作领导小组办公室）

承担对全市检察机关执行法律、法规和市人民检察院规定、决定的情况进行督察。承担内部审计工作。承担市人民检察院党组巡察工作领导小组日常工作。

计划财务装备处

制定实施全市检察机关财务和装备规划，编制市人民检察院支出规划和部门预决算。负责市人民检察院本级财务管理、国有资产管理、政府采购等工作。

政治部 （保留法警支队牌子）

负责本部门本系统思想政治、组织人事、宣传教育等工作。负责警务管理工作。

机关党委

负责机关党建、党群工作。

党组书记、检察长：李郁军

党组成员、副检察长：王锐

党组成员、副检察长：蒲军

党组成员、政治部主任：周永麟

党组成员、纪检监察组组长：周宏

党组成员、副检察长：胡相元

党组成员、副检察长：马如栋

副检察长：柳小惠

曾获“全国文明单位”称号，先后被评为全国检察机关“文明接待示范窗口”、全国和全省“节约型公共机构示范单位”、全市党建工作示范点。

2017年11月，兰州市人民检察院获得中央精神文明建设指导委员会授予的“第五届全国文明单位”荣誉称号。

2020年7月，被最高检表彰为“法治进校园”全国巡讲活动表现突出单位。