关东地方环境事务所直辖；成田自然保护官事务所、成田自然保护官事务所、小笠原自然保护官事务所、南阿尔卑斯自然保护官事务所（伊那事务室、静冈事务室）、佐渡自然保护官事务所、桧枝岐自然保护官事务所、片品自然保护官事务所；

新潟事务所；

日光自然环境事务所辖：日光汤元自然保护官事务所、日光汤元自然保护官事务所；

箱根自然环境事务所辖：富士五湖自然保护官事务所、沼津自然保护官事务所、下田自然保护官事务所。