医院设有蒙医甲状腺病专科、蒙医肺病科、胸外肿瘤科、眼科、蒙医内分泌科、心血管内科、蒙医包氏正骨科、脑外科、蒙医点穴反射疗法科、蒙医消化二科、蒙医针推科、心胸外科、蒙医风湿病科、耳鼻喉科、蒙医老年病科、蒙医传统正骨科、蒙医布病·关节病科、蒙医肾病科、肛肠科、蒙医儿科、泌尿外科、蒙医传统内疗科、手术麻醉科、妇科、蒙医五疗药浴中心神经内科、血液透析室干部保健综合内科、普外科、呼吸内科、急诊科、西医内分泌科、口腔科、骨外科、蒙医贴敷门诊蒙医整骨科、蒙药制剂中心、重症医学科、临床检验中心、功能检查科、影像中心、药学部、病理科、供应室等临床和医技科室。

2020年12月，被评为2019-2020年节约型公共机构示范单位。