1989年，内蒙古自治区哲学社会科学联合会从社会科学院分出另设。

2008年，内蒙古社科院出台《内蒙古社会科学院院所文化建设意见》。

2009年，内蒙古社科院印发《内蒙古社会科学院规章制度汇编》。

截至2024年6月，内蒙古社科院有在职职工234名，离退休人员160名。其中，在职专业技术人员171名。正高级专业技术职务聘用39名，副高级专业技术职务聘用63名，中级专业技术职务聘用50名，初级专业技术职务聘用17名，其中，二级研究员3名。管理岗位77名，其中，正厅级2名，副厅级4名，正处级19名，副处级24名，科级33名；现有技术人才中，享受国务院特殊津贴1名，自治区有突出贡献中青年专家3名，新世纪321人才一层次7名、二层次25名（历年入选合计），西部之光访问学者6名，自治区“草原英才”10名，自治区“草原英才”工程青年创新创业人才3人，自治区青年创新人才6名，国家民委民族问题研究优秀中青年专家1名，自治区人才开发基金2名，国家百千万人才工程1名。

国务院特殊津贴：树林

国家百千万人才工程：树林

自治区四个一批人才：王关区

自治区有突出贡献中青年专家：王关区、树林、白永利

自治区新世纪321人才：王关区、萨日娜、全荣、李春梅、山丹、韩成福、铁军、白永利、文明、娜仁其木格、朱檬、呼日乐吐什、班布日、武振国、金书包、木仁、刘小燕、张立伟、金洁

西部之光访问学者：范丽君、张敏、武振国

自治区草原英才：萨日娜、黄金、图雅 、全荣、树林、白永利、娜仁其木格、王海荣、其乐木格、武振国、呼日乐吐什、康建国

自治区青年创新人才：全荣、文明、张立伟、铁军、张敏、康建国

截至2024年6月，内蒙古社科院设有15个研究（院）所，14个盟市分院。

研究（院）所：马克思主义研究所、铸牢中华民族共同体意识研究院、哲学与宗教研究所、经济研究所、牧区发展研究所、历史研究所、语言研究所、文学研究所、北方多语种文献研究所、民族研究所、政治学与法学研究所、社会学研究所、北疆文化研究所、公共管理研究所、内蒙古“一带一路”研究所

盟市分院：呼和浩特分院、包头分院、鄂尔多斯分院、巴彦淖尔分院、乌海分院、阿拉善分院、乌兰察布分院、锡林郭勒分院、赤峰分院、通辽分院、兴安分院、呼伦贝尔分院、满州里分院、二连浩特分院

截至2023年5月，内蒙古社科院图书馆各类藏书26万册，其中蒙古文古籍6280种3万余册，约占全国各图书馆蒙古文古籍收藏种类的50%；汉文古籍3000余部，5万余册，其中明清版本比例较大；日、俄、英、德、法等外文原版图书约2万册。蒙、汉文普通版图书约16万册，期刊合订本约9000册。

截至2017年5月，内蒙古社科院共出版各类著作500余部，发表论文、调研报告及学术文章7000多篇，开发蒙古语信息技术应用软件20多项；获全国精神文明建设“五个一工程”奖、国家哲学社会科学规划项目优秀奖、国家图书奖、中国图书奖和自治区哲学社会科学优秀成果等国家级、省部级各类奖项280余项，获得国家及自治区社会科学规划课题200余项。

截至2024年6月，内蒙古社科院出版有《内蒙古社会科学》（国家社科基金资助期刊、中国人文社会科学引文索引（CSSCI）来源期刊、全国中文核心期刊、中国人文社会科学期刊AMI综合评价（A刊）核心期刊、RCCSE中国核心学术期刊、人大复印报刊资料重要转载来源期刊）、《内蒙古社会科学（蒙文版）》、《中国蒙古学》（蒙文）和《北疆文化研究》4个学术刊物。

《内蒙古社会科学》主要开设政治、哲学、法学、经济、文学、社会、语言、教育、历史、民族文化、蒙古国研究、西部论坛等多个栏目；为国家社科基金资助期刊、中文社会科学引文索引（CSSCI）来源期刊、全国中文核心期刊、中国人文社会科学综合评价AMI核心期刊、RCCSE中国核心学术期刊；所刊发的论文被《光明日报》、《新华文摘》、《人大复印报刊资料》等转载或摘介。

《中国蒙古学》为国际交流综合性学术双月刊，设有语言文字、文学艺术、历史文化等固定栏目及政治、经济、法律、文献等多个非固定栏目，其中历史文化栏目为特色专栏。

截至2009年7月，内蒙古社科院拥有院重点学科4个。

院重点学科：蒙古学、民族问题研究、区域经济研究、草原文化学

LOGO整体外形似“S”形，既取自“社”字的首字母，又体现社会与科学SOCIAL SCIENCE英文首字母，下方的字母“A”则是学院ACADEMY的英文首字母。上方彩色条状代表社会、人文、历史等等元素的多元化，“A”顶端山脉的造型寓意民族文化龙脉相传，延绵不断。下方像一本卷起来的书籍，体现了文化的属性。logo整体呈现蓝绿色调，既体现了生命活力与希望。又体现了科技科学的行业属性。

办院方针：守正创新，担当作为