中心立足于“科学、公正、严谨、规范”的质量方针，以成为全国范围内知名权威微生物产品质量检测机构为目标，以对接国际标准与要求为己任。近年来中心发展迅速，人员逐年增加，更加注重人员的素质和创新能力，在人员的培训、上岗和持续能力保持上严格要求；实验室建设进一步加强，新技术和新设备不断被引进；管理体系日趋成熟，形成了机构内管理实践与管理体系循环渐进的良好形势。

中心位于微生物农药国家工程研究中心大楼四楼，办公室及实验室面积1,600平方米拥有气质联用仪、高效液相色谱仪、原子吸收分光光度计、元素分析仪、气相色谱仪、高速冷冻离心机等大型精密仪器设备45余台（套），固定资产（原值）600多万元，满足中心所需检测项目的需要。

中心在行业学术带头人的领导下取得了丰硕的科研成果。在微生物肥料研究方面，开发了多粘芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌等多种农用微生物的发酵工艺，促进农用微生物的生产与普及，推动了微生物对土壤改良方面的巨大作用；在微生物环境治理方面，开发了净化水质的枯草芽孢杆菌、菌剂、固体发酵工艺与应用技术以及微生物综合环境治理技术，在池塘、湖泊、河流等水体的治理，畜禽养殖场环境的治理上取得了显著的成效，受到业内好评。在生物农药研发上，开发了苏云金芽胞杆菌高毒力菌株、改进了阿维菌素和井冈霉素的发酵和生产工艺，制定了苏云金芽胞杆菌原粉、可湿性粉剂和悬浮剂的产品标准，为生物农药的研发、生产和标准化做出了突出贡献。在食用菌菌种真实性鉴定方面，开发了香菇SSR标记、INDEL标记、SNP标记等新型特异性分子标记，为提高检测结果的可靠性提供了新的储备技术。开展了香菇、双孢菇对重金属铅砷汞镉吸收富集规律的研究，为控制食用菌重金属污染提供了技术支撑。