在此之前，在全国人大讨论《中华人民共和国乡镇企业法》时，就有人提出反对意见，认为乡镇企业包括各类企业，都有了相关的法律，没有必要单独为乡镇企业立法，时任人大常委副委员长的田纪云与许多人大常委认为“异军突起”的乡镇企业是以农民为主体的企业，是农民的一个重大创造，是市场经济的先导力量，关系到九亿农民的切身利益，有其特殊性，需要单独立法，最后通过了《中华人民共和国乡镇企业法》。在推进地方政府机构改革中，许多地方将乡镇企业局合并到“中小企业局”，与城市的中小企业实行统一管理。但是有许多乡镇企业已不是中小企业，而是上市的大企业，有的已经走向国际，在海外收购外国的企业，像鲁冠球的万向集团，中国江苏的华西{集团}村等。乡镇企业作为企业，与其他企业既具有共性，而又有与其他企业不同的特殊性。特别是在城乡分割的二元经济社会结构尚未根本消除的背景下，重视和维护乡镇企业的特殊性并支持其发展，仍然是十分必要的。