冯鹏翥生于1888年（清光绪十四年）。1908年入太原陆军小学，后加入中国同盟会。1911年入北京陆军第一中学。辛亥革命时期回山西参加革命活动。历任晋军都督府招待员，步兵队队长。1914年5月毕业于陆军第一预备学校，后被派任奉天陆军候补生。11月入保定陆军军官学校第二期炮科。1916年5月毕业回山西后，历任大同炮兵连长、兵营教员、国民师范学校军事学教员、督军公署副官等职。1924年11月后任陆军第一旅军务帮办、督军公署参谋、陆军第三十团团长、朔县及神池等处城防司令、炮兵第七团团长兼炮兵副司令。1927年任北方国民革命军左路炮兵司令。1928年任第三集团军炮兵第七旅旅长。是年10月任第三集团军暂编第十一师师长，11月另任第四十二师师长。1929年任国军编遣委员会第三编遣区第九组组长。1930年3月升任第三方面军第九军军长，11月任孟辽防区守备副司令。1931年任第四师师长，不久调任第六十七师师长。1932年兼任太原绥靖公署副官长。1936年1月23日授中将衔。1944年在四川病逝。