凝胶化作用延续到成岩阶段。凡在显微镜透射光下呈橙色、褐橙色的镜质组显微组分，都是凝胶化作用的结果。一般认为，凝胶化作用是在强覆水缺氧的滞水沼泽中进行的。在凝胶化过程中，植物的细胞壁由于液体浸润而膨胀，逐渐转为凝胶化物质，同时细胞腔相应地缩小。在凝胶化作用初期，植物的细胞壁仅仅开始膨胀，大致还保持着细胞的原来排列。若在此阶段，由于条件改变，凝胶化作用停止，保存下来的即为将来具有木煤结构的木煤体；若凝胶化作用进行到植物组织强烈膨胀，只残留少数不规则的细胞腔时才停止，则保留下来的是具有木质镜煤结构的木质镜煤体；若凝胶化作用进行到植物细胞腔完全消失时，则保留下来的就是具有镜煤结构的镜煤体。假如这样形成的凝胶继续处于强覆水的弱氧化条件下，则将通过分散作用而形成溶胶。溶胶中混入了形态分子或矿物质再转化为凝胶时，保存下来的即为凝胶化基质。上述各种凝胶化组分在凝胶化过程中各定型于相应的凝胶化阶段，但在实际成煤过程中，具有形成上述各种组分的条件往往同时存在。