凭祥老火车站始建于上个世纪50年代，是国家一类口岸。

随着中国－东盟自由贸易区建设的加快，凭祥站与凭祥（铁路）口岸接待中外过境旅客及承接的运输量急剧增加，近年来接待量达30多万人次，原有设施已难以适应需要。为了进一步加强凭祥铁路口岸的软硬环境建设，提升口岸的通关效率和服务水平，树立良好的“国门形象”，中国中央和地方共同出资1333万元，建设凭祥火车站与凭祥（铁路）口岸旅客联检大楼。工程由柳州铁路局（今中国铁路南宁局集团有限公司）承建，铁四院柳州勘测设计院设计，是集人流、物流、资金流和信息流为一体，具有设施现代化、功能多样化的国际口岸。

凭祥站位于湘桂线上，通过凭祥铁路口岸可到达越南境内。