更新时间：2024-06-25 09:41
2002年11月8日， 《分子植物育种》由国家科技部批准，国家新闻出版署核准。
2003年，该刊正式创刊，双月刊。
2014年，该刊入选原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊名单。
2015年，该刊正式改为月刊，每月28日公开发行。
2018年，该刊正式改为半月刊，每月14日和28日公开发行。
《分子植物育种》围绕水稻、小麦、玉米、油菜、大豆、棉麻、薯类、果树、蔬菜、花卉、茶叶、林业和草木等，刊登分子遗传育种理论、分子育种方法、分子育种研究动态以及优良种质培育等方面的科学论文报道。
《分子植物育种》设置固定栏目和随机栏目。固定栏目常设研究论文（Research Article）和研究报告（Re- search Report），主要发表最新的原始研究成果。随机栏目根据稿源可能设研究评述（A Review）、研究资源（A Resource）、数据分析（Analysis）、技术主题（Techno- logy Feature） 等栏目，还可能设置刊登有关科学新闻、科学简讯、专利、短评、书评等方面的栏目。
《分子植物育种》读者对象是从事农作物科学研究的科技工作者、大中专院校师生和具有同等水平的专业人士。
据2018年6月《分子植物育种》官方网站显示，编委会有编委成员26人，编辑团队有责任编辑2人、制作编辑2人。
编委会编委成员：
责任编辑：钟建立、郭天霞
制作编辑：利妲、王海妹
分子植物育种理论与实践研讨班
“分子植物育种理论与实践研讨班”是海南省生物工程协会每年一期定期主办的学术活动。2001-2004年，已经成功主办了4期，参加培训的学员遍布中国各个省市，得到参与学员的良好评价。第5期“分子植物育种理论与实践研讨班”于2005年8月2-10日在海南省热带农业资源开发利用研究所举行，由海南省农作物分子育种重点实验室和《分子植物育种》编辑部承办。
《分子植物育种》被北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》（2011~2014年版）之核心期刊、中国科学技术信息研究所的中国科技论文统计源期刊之核心期刊、中国科学院文献情报中心的中国科学引文数据库（CSCD）核心库入选期刊、RCCSE中国核心学术期刊、中国知网的中国期刊全文数据库（CJFD）、维普的中文科技期刊数据库、万方公司的中国核心期刊（遴选）数据库、中国生物学文献数据库（CBA）收录、美国化学文摘（CA）、国际农业与生物科学研究文摘（CABI）、台湾华艺数据库（TEPS）等收录。
据2018年6月28日中国知网显示，《分子植物育种》共出版文献5265篇。
据2018年6月28日万方数据知识服务平台显示，《分子植物育种》共载文1946篇。
据2018年6月28日中国知网显示，《分子植物育种》总被下载925290次、总被引35583次、（2017版）复合影响因子为0.935、（2017版）综合影响因子为0.680。
据2018年6月28日万方数据知识服务平台显示，《分子植物育种》被引量为25171、下载量为87654；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《分子植物育种》影响因子为0.765，在全部统计源期刊（6735种）中排第第1654名，在农学（9种）中排第2名。
（1）荣获2005年~2007年度海南省首届出版物政府奖二等奖；
（2）荣获2008年~2010年度海南省第二届出版物政府奖三等奖；
（3）荣获2011年~2013年度海南省第三届出版物政府奖二等奖。
该刊宗旨为“立足国内，面向国际”。
据2018年6月《分子植物育种》官方网站显示，现任领导名单如下：