有徒手切片法与切片机切片法二种。经固定、脱水后的组织用石蜡包埋的石蜡切片法是最常用的方法，可连续切出厚薄为1—10微米的切片。但是这种方法不能用于大的组织和硬组织的切片，此外还存在着组织发生显著收缩，由于存在有机溶剂会将组织中的物质溶出，以及切片操作受到室温的影响等缺点。火棉胶切片法是先将组织固定、脱水，然后经无水酒精-乙醚混合液处理，再用火棉胶浸渍、包埋、切片。这种切片法可将大的组织进行切片，并且还具有热不会使组织收缩等优点，但由于切片并不能切的很薄（20微米以上），而且火棉胶浸渍处理很费时间，这些都是缺点。碳蜡（carbowax）切片法是将组织固定、水洗后直接包埋在碳蜡中进行切片。短时间内就可切出很薄的切片（1—10微米），组织收缩很少，染色性也好。此外由于不使用有机溶剂，所以用此法可检验出组织中存在的脂肪和酶等。但缺点是对大的组织切片的制作不适合，并受室温影响。冰冻切片法是将新鲜的组织决迅速冻结，所以切片制作没有脱水和透明过程的影响，短时间内就可切片，所以多用于细胞化学和组织化学的研究以及手术试验切除组织片的检查。木材的切片制作是用醋酸纤维素法。电子显微镜的超切片法是将经过组织固定、脱水、树脂包埋的小块用超薄切片机切成厚度在100毫微米以下的超薄切片。