更新时间:2024-05-21 15:00
剪接变体,是选择不同的剪接位点而产生的变体。
剪接变体是选择不同的剪接位点而产生的。
从一条前mRNA链是如何产生多种剪接变体的呢?现在一般认为,一个基因主要通过四种基本方式来进行选择性剪接, 通过选择不同的剪接位点从而产生不同的成熟mRNA,最终导致不同的蛋白质产物。
一、 无剪接和正确剪接。 内含子可以被选择性的剪接掉,也可以不被剪接而保留,成为RNA编码区域的一部分。这种现象就是常说的剪接与否,当然,这也将产生几种不同的结果。例如,如果这个内含子包含了读码框中的终止密码子,那么包含了这种内含子的剪接变体将可能最终产生一种更短而又没有功能的蛋白质。相反,如果这个内含子被剪接掉,其最终的mRNA在开放式读码框中生产一种功能性蛋白。在这种情况下,选择性剪接就像一个可以进行选择有无的开关。另一种可能的情况是,这种选择性剪接产生两种具有不同碱基序列的mRNA,结果是会产生两种不同的蛋白,他们有不同的氨基酸序列,可能会有不同的功能,但会相关。而在这种情况下,选择性剪接就像是产生不同mRNA而最终产生不同蛋白的一个开关。
二、5'或3'端竞争性剪接(Competing 5' or 3' Splice Site) 这种剪接方式是由于在同一个内含子内部的3'端存在5'端竞争性位点,相应的,也可能是5'端存在3'端位点。离内含子另一端较近的竞争性位点称为近端剪接位点(the proximal splice site), 而较远的竞争性位点则称为远端剪接位点(the distal splice site)。选择近端剪接位点还是远端剪接位点,将导致生成不同的mRNA,这两种mRNA的区别就在于是否含有这两个位点间的碱基序列。就像第一种情况一样,这种剪接方式也会产生开关效应或者产生两种不同的蛋白质。
三、外显子跳跃(Exon Skipping) 当一个外显子连同它两端的内含子一起被剪接而不能出现在成熟mRNA中时,我们说这个外显子被跳过,也就是外显子跳跃。当然,可能的情况是多个外显子一起被跳过。这种机制将会产生多种蛋白。以一个有8个外显子的基因为例,其中的一种剪接体可能含有所有的8个外显子,而另一个则跳过了外显子7,抑或跳过了外显子2和外显子3,再或者就是跳过了外显子4和外显子5等等。因此,外显子跳跃很可能产生多种蛋白,当然也就可以拥有第一和第二种情况下选择性剪接的功能。
四、外显子互斥(Mutually Exclusive Exons)这种剪接方式与外显子跳跃相关,这种情况下,mRNA中可以拥有互斥的两个外显子中的一个且只能拥有一个。举例来说,假设一个基因有4个外显子,它的一个剪接变体含有外显子1、2、4,而另一种则只含有1、3、4。