湖区属羌塘高原寒带干旱气候，年均气温-10℃~-8℃，年降水量100~150mm。集水面积1 680.0km2，补给系数7.4。湖水主要依赖冰雪融水径流和泉水补给，入湖河流中东泉河最大，长30.0km，源于马兰雪山，冰雪覆盖面积约13.0km2，汇冰雪融水和泉水；次为西岸入湖的无名河，长38.0km，源于东岗扎日冰川北坡，上游汇冰川融水，下游纳泉水，水量较丰。据1989年7月调查，卤水密度1.093，透明度1.0m（水深1.5m）；pH值7.00，矿化度135.26g/L，阳离子Na+、K+、Mg2+、Ca2+含量分别为44 755.4、2 320.0、2 191.7、2848.0mg/L，阴离子Cl-、SO42-、CO32-、HCO3-含量分别为81 086.3、2 112.2、9.1、166.3mg/L，属氯化物型盐湖；Li、B含量171、88.0mg/L。湖区植被为苔草和紫花针茅草草原。